抑制剂172结合囊性纤维化跨膜传导调节因子E1371Q突变体的单颗粒冷冻电镜分析
EMPIAR-12044 抑制剂172结合囊性纤维化跨膜传导调节因子E1371Q突变体的单颗粒冷冻电镜分析 6.4 抑制剂172结合的人囊性纤维化跨膜传导调节因子E1371Q突变体显微图像的未对齐多帧显微图像 - 多帧TIFF
基本信息
资源简介
抑制剂172结合囊性纤维化跨膜传导调节因子E1371Q突变体的单颗粒冷冻电镜分析
该数据集围绕囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）E1371Q突变体与抑制剂172结合状态开展单颗粒冷冻电镜分析，属于呼吸道疾病尤其是囊性纤维化研究方向的结构生物学数据资源。数据集英文名称为 Single particle cryo-EM analysis of inhibitor 172 bound cystic fibrosis transmembrane conductance regulator E1371Q mutant，来源站为 ebi.ac.uk，对应 EMPIAR 条目 EMPIAR-12044。其核心内容为抑制剂172结合的人源CFTR E1371Q突变体显微图像，具体为未对齐的多帧显微图像，文件格式为多帧TIFF。该数据可用于观察蛋白-配体复合物的冷冻电镜原始成像信息，为后续图像处理与结构解析提供基础素材。
【数据集背景】
囊性纤维化是一种与CFTR功能异常相关的呼吸道疾病。CFTR作为跨膜传导调节因子，其突变体结构与配体结合状态的研究有助于理解相关分子机制。本数据集聚焦于E1371Q突变体与抑制剂172结合的样品，通过单颗粒冷冻电镜技术获取图像数据，属于该领域结构分析的基础数据。
【数据内容】
数据集包含抑制剂172结合的人囊性纤维化跨膜传导调节因子E1371Q突变体的显微图像。根据源站描述，这些图像为未对齐的多帧显微图像，采用多帧TIFF格式存储。数据对应“6.4”这一标识，具体含义源站未提供。数据内容不包含已对齐或重建后的三维密度图，仅为原始多帧图像。
【采集与来源】
数据来源于ebi.ac.uk，对应EMPIAR-12044条目。源站描述表明其为单颗粒冷冻电镜分析所获得的未对齐多帧显微图像。关于采集设备、放大倍数、像素尺寸、总帧数、曝光时间等具体采集参数，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于单颗粒冷冻电镜图像处理流程中的初始输入，例如运动校正、CTF估计、颗粒挑选等前期步骤。也可用于针对CFTR E1371Q突变体与抑制剂172结合状态的图像质量评估或方法学比较。由于数据为未对齐多帧图像，不适合直接用于三维重构或原子模型搭建，需经过后续处理。具体适用场景的边界源站未提供。
【使用方法】
使用者可下载多帧TIFF格式的未对齐显微图像，并导入常规冷冻电镜图像处理软件进行后续处理。处理步骤通常包括帧对齐、剂量加权、对比度传递函数校正、颗粒挑选与分类等。由于源站未提供详细元数据，使用前需自行确认图像尺寸、帧数及像素信息。本数据集不包含处理脚本或参数文件，相关操作需依据通用流程自行设定。
【质量与限制】
数据为未对齐多帧显微图像，尚未经过运动校正与CTF校正，因此图像质量受样品漂移、辐照损伤及成像条件影响。源站未提供分辨率、颗粒数量、数据收集完整度等质量指标。该数据集仅覆盖抑制剂172结合的E1371Q突变体，不包含其他突变体或配体状态。此外，源站未提供任何验证性结论或结构模型，使用时应避免直接推断最终结构。
【引用与许可】
源站未提供具体的引用格式与许可条款。使用该数据集时，应遵循EMPIAR及ebi.ac.uk的通用数据使用政策，并建议在相关出版物中注明EMPIAR-12044条目。具体引用要求与许可细节需查阅源站页面。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-12044
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMPIAR-12044 Single particle cryo-EM analysis of inhibitor 172 bound cystic fibrosis transmembrane conductance regulator E1371Q mutant 6.4 Unaligned multi-frame micrographs of inhibitor 172 bound human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator E1371Q mutant micrographs - multiframe TIFF
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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