人NEK10敲除气道ALI Fe-IMAC-MSMS
该数据集来自 omicsdi.org，主题为人类 NEK10 基因敲除对气道磷酸化蛋白质组的影响。研究在人类气道气液界面（ALI）培养体系中，采用 CRISPR/Cas9 技术以 2 条独立 guide 靶向 NEK10，并通过铁富集磷酸化蛋白质组学（Fe-IMAC-MSMS）进行检测
基本信息
资源简介
人NEK10敲除气道ALI Fe-IMAC-MSMS
该数据集名为 Human NEK10 knockout airway ALI Fe-IMAC-MSMS，收录于 omicsdi.org，本站分类归入呼吸道疾病下的支气管扩张方向。其核心内容围绕人类 NEK10 基因功能缺失对气道磷酸化蛋白质组的影响展开。研究者在人类气道气液界面（ALI）培养体系中，利用 CRISPR/Cas9 技术，以 2 条独立 guide 靶向 NEK10，并通过铁富集磷酸化蛋白质组学（Fe-IMAC-MSMS）进行检测。该数据集的主题标签包括 Human、Nek10、Phosphoproteomics、Airway，整体上服务于理解 NEK10 失活突变在新型人类支气管扩张综合征背景下对气道磷酸化信号网络的作用。
【数据集背景】
NEK10 是一种人类蛋白激酶，此前对其特性了解有限。相关研究在一种新型人类支气管扩张综合征中鉴定到 NEK10 的失活突变。为了解该蛋白功能丧失对气道磷酸化蛋白质组的影响，研究者选择在人类气道气液界面（ALI）培养体系中开展实验，通过 CRISPR/Cas9 技术对 NEK10 进行靶向敲除，并采用铁富集磷酸化蛋白质组学方法进行检测。该数据集即产生于这一研究背景，旨在从磷酸化蛋白质组层面刻画 NEK10 功能缺失所引发的分子变化。
【数据内容】
该数据集的主题为人类 NEK10 基因敲除对气道磷酸化蛋白质组的影响。实验在人类气道气液界面（ALI）培养体系中完成，采用 CRISPR/Cas9 技术以 2 条独立 guide 靶向 NEK10，并通过铁富集磷酸化蛋白质组学（Fe-IMAC-MSMS）进行检测。数据集英文名中的 Fe-IMAC-MSMS 指明了所采用的铁富集与质谱联用策略。主题标签涵盖 Human、Nek10、Phosphoproteomics、Airway。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、磷酸化位点数目、定量结果或具体差异磷酸化蛋白列表等更细粒度的数据内容描述。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述，研究者在人类气道气液界面（ALI）培养体系中，使用 CRISPR/Cas9 技术以 2 条独立 guide 靶向 NEK10，并通过铁富集磷酸化蛋白质组学进行检测。本站将其分类为呼吸道疾病 / 支气管扩张。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、培养条件细节以及质谱仪器型号等，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于关注 NEK10 功能缺失对气道磷酸化蛋白质组影响的研究场景，尤其是与人类支气管扩张综合征相关的分子机制探索。其气液界面（ALI）培养体系与铁富集磷酸化蛋白质组学（Fe-IMAC-MSMS）设计，可用于分析 CRISPR/Cas9 靶向 NEK10 后气道细胞磷酸化信号的变化。主题标签 Human、Nek10、Phosphoproteomics、Airway 也提示其可服务于人类气道磷酸化蛋白质组学相关研究。除上述方向外，源站未提供其他具体适用场景说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或参数设置等。使用者如需利用该数据集，需参考来源站 omicsdi.org 的原始说明。源站未提供进一步的使用指引。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、覆盖度、重复性、假阳性率或技术偏差等方面的信息。该数据集基于 2 条独立 guide 的 CRISPR/Cas9 靶向策略与铁富集磷酸化蛋白质组学检测，但源站未提供具体的质控指标或限制说明。使用者应结合来源站信息自行判断其适用性。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。如需引用或使用，请查阅 omicsdi.org 上该数据集的原始页面以获取相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD016600
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们在一种新型人类支气管扩张综合征中发现了NEK10的失活突变，NEK10是一种特征尚不明确的人类蛋白激酶。为了理解其功能丧失对气道磷酸化蛋白质组的影响，我们使用2个独立的引导RNA通过CRISPR/Cas9技术靶向敲除人气道气液界面（ALI）培养物中的NEK10，并通过铁富集磷酸化蛋白质组学进行了检测。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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