子宫内呼吸上皮编程：羊膜上皮甲基化组的启示

数据集获取

源站：https://doi.org/10.17632/xsch4ysfsn.1

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 7.10 GB。

数据说明

背景：气道上皮调节异常可导致反复喘息和哮喘，并可能具有发育起源。本研究探讨了胎盘羊膜与鼻上皮甲基化图谱之间的关系，以确定羊膜上皮能否为了解呼吸组织的胎儿编程提供线索。方法：我们在气道上皮呼吸道疾病与过敏（AERIAL）队列中，对84对匹配的胎盘羊膜和新生儿鼻刷样本进行了高通量靶向捕获DNA甲基化测序。研究比较分析了组织特异性甲基化谱，并探讨了与妊娠期暴露（母亲吸烟和母亲哮喘）相关的甲基化改变的保守性。结果：在羊膜与鼻组织之间，我们识别出4，897个差异甲基化区域（FDR ≤ 0.05且log2FC > |0.2|），这些区域在鼻上皮中总体呈高甲基化状态。

尽管存在这些广泛的组织特异性差异，筛选差异甲基化不显著（FDR > 0.1）的位点后发现，有1，493，976个CpG位点（约占所测甲基化组的20%）在组织间具有高度一致的甲基化比率水平（Pearson’s R > 0.8）。这些位点包括对上皮和肺发育至关重要的基因。在这些保守区域内，与母亲哮喘和产前吸烟的关联在两种组织中均一致呈现。结论：保守的甲基化组特征支持使用羊膜组织作为研究气道易感性发育编程的有价值组织，可能有助于早期风险分层和儿童哮喘的靶向干预。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。