HDM诱导哮喘小鼠乳酸钠干预肺组织RNA-seq转录组
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1480033），为 HDM 诱导哮喘小鼠经乳酸钠干预后的肺组织 RNA-seq 转录组测序数据，主题标签为 Raw sequence reads
基本信息
资源简介
HDM诱导哮喘小鼠乳酸钠干预肺组织RNA-seq转录组
该数据集为 NCBI BioProject 收录的编号 1480033 项目，英文名称为“PRJNA1480033: RNA-seq transcriptome profiling of lung tissue from HDM-induced asthmatic mice with sodium lactate intervention”。从名称可以看出，该项目围绕屋尘螨（HDM）诱导的哮喘小鼠模型展开，并对这些小鼠进行乳酸钠干预，随后采集肺组织进行 RNA-seq 转录组测序分析。数据集在分类上归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为 Raw sequence reads，即原始序列读长。整体而言，该数据集提供了与哮喘动物模型及乳酸钠干预相关的肺组织转录组测序原始数据，可供研究者了解该项目所生成的生物数据及其组织方式。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 1480033。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据，这些数据通常来自单一机构或联合体。一个 BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，便于查找该项目所产生的不同类型数据。本项目聚焦于呼吸系统疾病中的哮喘，具体涉及 HDM 诱导的哮喘小鼠模型以及乳酸钠干预，属于转录组学层面的研究数据集合。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，表明其核心内容为原始序列读长。结合项目名称可知，这些原始序列读长来自肺组织 RNA-seq 转录组测序，样本为经 HDM 诱导的哮喘小鼠并接受乳酸钠干预后的肺组织。数据集在分类上属于呼吸系统疾病 / 哮喘。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长长度、数据量等更具体的描述。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1480033 - BioProject - NCBI”。其采集对象为 HDM 诱导的哮喘小鼠在接受乳酸钠干预后的肺组织，通过 RNA-seq 技术进行转录组测序，生成原始序列读长。关于具体的采集时间、地点、实验条件、干预剂量与周期等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与哮喘相关的呼吸系统疾病研究，尤其是围绕 HDM 诱导哮喘动物模型以及乳酸钠干预机制的转录组分析。研究者可利用原始序列读长进行后续的比对、定量与差异表达分析，从而探索肺组织在哮喘及干预条件下的转录组变化。此外，该数据集也可作为 BioProject 项目数据组织方式的示例，用于了解 NCBI 如何汇集某一研究计划下的多种数据类型。关于更具体的适用分析流程或研究问题，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 NCBI BioProject 编号 1480033 查找并获取与该项目相关的数据链接。由于主题标签为 Raw sequence reads，使用者通常需要先获取原始序列读长，再根据自身研究目的进行质量控制、比对和表达分析等处理。关于数据的具体下载方式、文件格式以及推荐分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 收录的项目，提供原始序列读长。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、重复性以及潜在偏差等信息，源站未提供。使用者在使用时需自行评估数据质量，并结合项目名称所反映的 HDM 诱导哮喘小鼠及乳酸钠干预背景进行解读。由于源站未提供详细的实验设计与样本信息，该数据集在解释和应用上可能存在一定限制。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1480033 - BioProject - NCBI”。关于具体的引用方式、许可条款以及使用限制，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 的相关政策与源站页面说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1480033
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在探索乳酸钠对屋尘螨诱导的小鼠过敏性哮喘治疗效果的转录组改变及分子机制。我们建立了屋尘螨挑战的哮喘小鼠模型，并设置两个实验组：仅接受屋尘螨暴露的模型组（n = 4个生物学重复）和接受屋尘螨刺激加乳酸钠治疗的干预组（n = 4个生物学重复）。从所有小鼠的肺组织中提取总RNA，随后进行文库构建和RNA-seq转录组测序。通过差异表达基因分析、功能富集分析和通路分析，鉴定乳酸钠在哮喘肺组织中调控的核心基因和信号通路。该数据集提供了全面的转录组资源，有助于阐明乳酸钠对气道炎症和上皮损伤的保护作用，促进发现哮喘的新治疗靶点。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
