PRJEB20494：马血清miR-128作为哮喘潜在生物标志物
MicroRNAs调控转录后基因表达，并可通过外泌体从细胞输出或与RNA结合蛋白结合。体液中的循环microRNAs可能以类似激素的方式发挥作用，在疾病发生和进展中起重要作用
基本信息
资源简介
PRJEB20494：马血清miR-128作为哮喘潜在生物标志物
PRJEB20494 数据集聚焦于马哮喘的血清 microRNA 生物标志物研究，来源于 ebi.ac.uk，本站归类为呼吸系统疾病 / 哮喘。该研究基于马哮喘模型，采集对照马与哮喘马的血清样本开展小 RNA 下一代测序及差异表达分析，并进一步检索显著失调 miRNA 的基因靶点，在与血清同批采血获得的外周血单核细胞中考察其差异表达。研究最终鉴定出四个 microRNA 的表达存在显著差异，为循环 microRNA 作为哮喘生物标志物提供了马模型层面的证据。数据集整体围绕血清 miR-128 作为马哮喘潜在生物标志物这一主题组织，适合关注呼吸系统疾病分子标志物、非编码 RNA 调控及动物模型转化研究的人员参考使用。
【数据集背景】
MicroRNAs 调控转录后基因表达，并可通过外泌体从细胞输出或与 RNA 结合蛋白结合。体液中的循环 microRNAs 可能以类似激素的方式发挥作用，在疾病发生和进展中起重要作用。因此，这些 microRNAs 被视为许多疾病有前景的生物标志物候选。该研究即在马哮喘模型中寻找血清 microRNA 生物标志物，以探索循环非编码 RNA 与哮喘状态之间的关联。
【数据内容】
数据集对应一项血清小 RNA 测序与差异表达分析研究。研究使用来自 35 匹对照马和 37 匹哮喘马血清的小 RNA 进行下一代测序，并开展进一步的差异表达分析。随后检索最显著失调 miRNA 的基因靶点，并在外周血单核细胞中研究这些靶点的差异表达，所用 PBMCs 与本研究血清样本来自同一批采血。研究鉴定出四个 microRNA 的表达存在显著差异。源站未提供更细粒度的数据文件清单、样本元数据表或表达矩阵说明。
【采集与来源】
样本为马血清，来自 35 匹对照马和 37 匹哮喘马；用于靶点验证的外周血单核细胞与血清样本来自同一批采血。数据来源站为 ebi.ac.uk。源站未提供采样地点、时间跨度、马匹品种、年龄、性别构成及伦理审批等更详细的采集信息。
【适用场景】
该数据集适用于马哮喘血清 microRNA 生物标志物的探索性研究，可用于了解循环 microRNA 在哮喘状态下的差异表达，支持对候选 miRNA 及其基因靶点在 PBMCs 中表达变化的参考分析。也可作为呼吸系统疾病分子标志物研究中动物模型数据的对照或方法学参考。源站未提供关于临床诊断应用、预后预测或跨物种外推的具体适用性说明。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法、数据下载格式、分析流程或软件参数。使用者需依据源站页面获取数据并自行设计分析方案；源站未提供标准化的处理步骤说明。
【质量与限制】
源站未提供测序深度、重复数、统计阈值、批次效应评估或独立验证队列等质量控制信息。研究样本量为 35 匹对照马与 37 匹哮喘马，属于马哮喘模型中的单一研究；源站未提供多中心验证或外部复现结果。对数据质量的判断需结合源站原始记录，源站未提供额外质量评级。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、作者列表、发表文献信息及数据使用许可条款。使用该数据集前应向源站核实引用要求与许可条件，源站未提供可在此转述的许可说明。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB20494
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
MicroRNAs调控转录后基因表达，并可通过外泌体导出细胞或与RNA结合蛋白结合。体液中的循环microRNAs可能以类似激素的方式发挥作用，在疾病的发生和进展中起重要作用。因此，这些microRNAs有望成为许多疾病的生物标志物。我们旨在识别马哮喘模型中的血清microRNA生物标志物。利用来自35匹对照马和37匹哮喘马血清的小RNA进行下一代测序及进一步的差异表达分析。随后，我们检索了最显著失调miRNA的基因靶标，并研究了这些靶标在源自与本研究血清样本同批采集的外周血单核细胞（PBMCs）中的差异表达。我们发现病例马与对照马之间四种miRNA的表达存在显著差异：eca-miR-128、eca-miR-744以及两个同源物eca-miR-107a和eca-miR-103。最显著失调的eca-miR-128和eca-miR-744还受到溶血程度的影响。
有趣的是，已知miR-128通过负向影响Th1成熟而促进Th2和Th17成熟，从而影响T细胞分化。因此，我们提出Th2/Th17型免疫反应是马哮喘病理生理学的基础。此前报道了miR-128的三十个潜在靶基因在未刺激或抗原刺激的PBMCs中存在差异表达。在未刺激细胞中上调的三个基因（RAB20、BAZ2B和HLX）此前已被报道与人类哮喘样病症相关。我们提出miR-128可作为马哮喘的潜在新生物标志物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
