PRJEB110841：对照与哮喘马BALF的illumination测序数据

资源简介

PRJEB110841：对照与哮喘马BALF的illumination测序数据

PRJEB110841 是一个聚焦呼吸系统疾病中哮喘主题的公开数据集，收录了来自对照马与哮喘马的支气管肺泡灌洗液（BALF）样本的 RNA-seq 测序数据。该数据集以冷冻保存的 BALF 样本为材料，采用 BULK RNA-seq 策略获取转录组层面的测序序列信息，所涉及的实验动物患有重度马哮喘（Severe equine Asthma）。数据集由 EBI（ebi.ac.uk）提供，属于呼吸系统疾病 / 哮喘分类下的组学数据资源，可用于比较健康对照与哮喘个体在 BALF 转录组层面的差异。整体而言，该数据集为马哮喘这一自然发病模型下的呼吸道样本转录组研究提供了原始测序序列层面的数据基础。

【数据集背景】

哮喘是一种以气道慢性炎症和气道高反应性为特征的呼吸系统疾病。马的重度哮喘（Severe equine Asthma）在临床表现和病理机制上与人类哮喘具有可类比之处，因此常被用作研究哮喘发病机制的自然疾病模型。支气管肺泡灌洗液（BALF）直接反映气道与肺泡腔内的细胞成分和分子环境，是研究气道炎症的重要样本类型。该数据集正是在这一背景下产生，旨在通过对照马与哮喘马 BALF 样本的 BULK RNA-seq 测序，为探索哮喘状态下气道转录组变化提供数据支撑。

【数据内容】

该数据集的核心内容是测序产生的 illumination 序列，即 RNA-seq 测序读段（reads）数据。样本来源为对照马与哮喘马的冷冻保存 BALF，测序策略为 BULK RNA-seq，即对样本中混合细胞群体的整体转录组进行测序，而非单细胞水平。数据覆盖两类生物学状态：健康对照与重度马哮喘。数据主题标签包括呼吸系统疾病、哮喘、马、BALF 与 RNA-seq，反映了数据的物种、样本类型、疾病背景与技术平台属性。关于样本数量、测序深度、读段长度、数据体积等具体参数，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 EBI（ebi.ac.uk），数据集标识为 PRJEB110841。样本采集自马匹的支气管肺泡灌洗液，灌洗液样本经冷冻保存后用于 BULK RNA-seq 测序。样本供体分为对照组与哮喘组，哮喘组马匹患有重度马哮喘。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、马匹品种与年龄等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于以下研究方向：马哮喘与对照之间 BALF 转录组的差异表达分析；气道炎症相关基因与通路的挖掘；马作为哮喘动物模型的跨物种比较研究；呼吸系统疾病转录组数据的整合分析与方法学验证。由于数据为 BULK RNA-seq，也适合用于评估混合细胞群体下转录组特征的统计方法。关于该数据集是否已用于特定发表研究，源站未提供。

【使用方法】

使用者可从 EBI 获取该数据集对应的测序序列数据，按照常规 RNA-seq 分析流程进行质控、比对、定量与差异分析。分析时应明确区分对照组与哮喘组样本，并在比较中考虑 BULK 测序所反映的混合细胞群体特征。关于参考基因组版本、比对工具与具体分析参数，源站未提供，需使用者根据马基因组资源自行确定。

【质量与限制】

该数据集基于冷冻保存的 BALF 样本，样本保存与处理过程可能对 RNA 完整性产生影响，使用时应关注测序读段的质量评估结果。BULK RNA-seq 无法区分不同细胞类型的表达贡献，在解释气道炎症相关信号时需注意这一局限。此外，数据集仅涵盖对照与重度哮喘两类状态，样本量与群体代表性信息源站未提供，外推结论时应保持谨慎。

【引用与许可】

该数据集来自 EBI，标识为 PRJEB110841。关于数据的具体引用方式、发表文献、许可条款与使用限制，源站未提供，使用者在下载与使用数据前应查阅源站的相关说明。