哮喘-COPD重叠及嗜酸性COPD患者人嗜酸性粒细胞RNA测序与分析

活化的嗜酸性粒细胞是主要参与过敏性疾病的主要细胞类型。近期研究还表明,嗜酸性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病(COPD)的发病机制中起重要作用,尤其是哮喘-COPD重叠和/或嗜酸性COPD

ena
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基因组分类呼吸系统疾病哮喘COPD嗜酸性粒细胞RNA测序哮喘-COPD重叠
PRJDB18141: RNA sequencing and analysis of human eosinophils in patients with asthma-COPD overlap and eosinophilic COPD

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

哮喘-COPD重叠及嗜酸性COPD患者人嗜酸性粒细胞RNA测序与分析

PRJDB18141 是一项聚焦人类嗜酸性粒细胞的 RNA 测序与分析研究,研究对象为哮喘-COPD 重叠(asthma-COPD overlap)患者及嗜酸性 COPD 患者。该数据集收录于呼吸系统疾病 / 哮喘分类之下,来源为 ebi.ac.uk。研究的基本出发点是:活化的嗜酸性粒细胞是主要参与过敏性疾病的主要细胞类型,而近期研究还表明,嗜酸性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病(COPD)的发病机制中起重要作用,尤其是哮喘-COPD 重叠和/或嗜酸性 COPD。基于这一背景,该研究旨在阐明哮喘-COPD 重叠和/或嗜酸性 COPD 患者人类嗜酸性粒细胞的细胞特征,所采用的技术路线为 RNA 测序及相应的分析。数据集整体围绕嗜酸性粒细胞的转录组层面刻画展开,为理解该类细胞在上述疾病状态下的生物学特点提供数据基础。

【数据集背景】

活化的嗜酸性粒细胞长期被认为是主要参与过敏性疾病的主要细胞类型。随着研究推进,学界逐渐认识到嗜酸性粒细胞的作用并不局限于过敏性疾病。近期研究还表明,嗜酸性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病(COPD)的发病机制中起重要作用,尤其是哮喘-COPD 重叠和/或嗜酸性 COPD 这两种情形。正是在这一认识背景下,本研究提出要澄清哮喘-COPD 重叠和/或嗜酸性 COPD 患者体内人类嗜酸性粒细胞的细胞特征。该数据集即对应这一研究目标所产生的 RNA 测序与分析数据,属于呼吸系统疾病 / 哮喘方向下与 COPD 相关的嗜酸性粒细胞研究资源。

【数据内容】

该数据集的内容为人类嗜酸性粒细胞的 RNA 测序数据及其分析结果,样本来自哮喘-COPD 重叠患者和/或嗜酸性 COPD 患者。数据围绕嗜酸性粒细胞的转录组信息组织,用于支撑对该细胞类型细胞特征的解析。除上述范围界定外,源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、分析步骤、结果文件类型等更细化的说明。

【采集与来源】

数据集来源于 ebi.ac.uk,编号为 PRJDB18141,英文名称为“RNA sequencing and analysis of human eosinophils in patients with asthma-COPD overlap and eosinophilic COPD”。其研究对象明确为哮喘-COPD 重叠和/或嗜酸性 COPD 患者的人类嗜酸性粒细胞。关于样本采集的具体机构、地点、时间范围、伦理审批信息以及测序服务的具体提供方,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕嗜酸性粒细胞在 COPD 相关疾病中作用的研究场景,尤其是针对哮喘-COPD 重叠与嗜酸性 COPD 的发病机制探索。由于研究目标在于阐明患者人类嗜酸性粒细胞的细胞特征,数据可用于比较和刻画该类细胞在相应疾病状态下的转录组表现,也可作为过敏性疾病与 COPD 交叉领域研究的参考数据。关于具体的下游分析类型或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 RNA 测序及分析为核心内容,使用时应围绕嗜酸性粒细胞的转录组数据展开。关于数据的具体获取方式、文件组织格式、预处理与标准化流程、分析工具与参数设置,源站未提供,需依据数据发布页面的实际说明进行操作。

【质量与限制】

该数据集基于患者来源的人类嗜酸性粒细胞 RNA 测序,其研究范围限定于哮喘-COPD 重叠和/或嗜酸性 COPD。关于样本量、数据完整性、测序深度、质量控制指标、批次效应以及结果的普适性边界,源站未提供,使用时应结合原始数据发布信息自行评估。

【引用与许可】

该数据集来自 ebi.ac.uk,编号 PRJDB18141。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献以及数据使用许可条款,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB18141

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

活化的嗜酸性粒细胞是主要参与过敏性疾病的主要细胞类型。近期研究还表明,嗜酸性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病(COPD)的发病机制中发挥重要作用,尤其是哮喘-COPD重叠和/或嗜酸性COPD。本研究旨在阐明哮喘-COPD重叠和/或嗜酸性COPD患者中人嗜酸性粒细胞的细胞特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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