反复暴露于木烟后非人灵长类气道上皮细胞持续转录组变化 [bisulfite-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327658

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

暴露于野火烟雾是一个重要的公共卫生问题，对呼吸系统影响尤为严重。野火事件的数量和严重程度不断增加，吸入野火烟雾可导致气道炎症、氧化应激诱导的肺损伤、黏液纤毛清除功能受损，以及哮喘和慢性阻塞性肺疾病（COPD）等呼吸系统疾病的加重。尽管这些健康风险已有充分文献记载，但野火烟雾暴露对呼吸系统影响的分子机制及恢复过程仍不完全清楚。本研究利用转录组学和表观基因组学分析，探究了木材烟雾（WS）暴露如何影响成年雌性恒河猴分化气管支气管上皮细胞中基因网络的表达模式。我们的分析识别出暴露诱导的差异甲基化区域、差异表达基因以及与肺部疾病相关的基因网络，包括免疫反应失调、氧化应激和细胞死亡、上皮屏障完整性和功能受损以及表观遗传重塑。

值得注意的是，在停止暴露一周后仍可检测到显著的转录组变化，这些变化富集于炎症、伤口愈合和组织修复相关通路。尽管存在这些转录组和表观基因组扰动，组织学染色显示，暴露于WS后上皮组织形态未见显著改变。然而，我们发现大量肺部疾病相关基因和通路的转录受到WS暴露的影响。本研究加深了对野火烟雾诱导呼吸系统效应的分子基础的理解，并凸显了WS可能对气道上皮留下持久印记，这对暴露人群的呼吸健康具有重要意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。