致命脑型疟疾的亚甲蓝治疗及潜在血液生物标志物鉴定

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE265864

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑型疟疾（CM）是由恶性疟原虫感染引起的一种严重并发症，可导致幸存者出现持续性神经损伤。为了理解其复杂机制并探索针对人类CM的先进诊断和治疗策略，我们利用感染了柯氏疟原虫的雄性恒河猴——一种与人类恶性疟原虫感染高度相似的非人灵长类模型。通过差异基因表达分析，我们的研究证明了亚甲蓝在逆转感染对脑干的有害影响方面的功效。此外，通过将我们从感染柯氏疟原虫的恒河猴中获得的脑干数据集与另外两个转录组数据集（感染柯氏疟原虫的恒河猴血液和感染恶性疟原虫的人类血液）进行比较，我们识别出九个与CM严重程度相关的基因。这些基因大多在中性粒细胞中表达，表明它们有潜力作为诊断恶性疟原虫所致致命性CM的血液生物标志物。这项研究强调了开发新型CM治疗方法的必要性，并揭示了有前景的生物标志物，可改善受影响个体的诊断和预后。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。