E-GEOD-61141:分化的哮喘人气道上皮培养物对鼻病毒的表型反应

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,聚焦分化的哮喘人气道上皮培养物在鼻病毒感染后的表型反应

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基因组分类Differential
E-GEOD-61141: Phenotypic responses of differentiated asthmatic human airway epithelial cultures to rhinovirus

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

E-GEOD-61141:分化的哮喘人气道上皮培养物对鼻病毒的表型反应

E-GEOD-61141 是一个聚焦呼吸系统疾病中哮喘方向的基因表达数据集,英文全称为 Phenotypic responses of differentiated asthmatic human airway epithelial cultures to rhinovirus。该数据集来源于 ebi.ac.uk,属于 EBI Expression Atlas 中的差异表达实验,研究物种为 Homo sapiens。其核心内容围绕分化的哮喘人气道上皮培养物在鼻病毒感染条件下所产生的表型反应展开,主题标签为 Differential,整体定位于通过差异表达分析刻画哮喘气道上皮在病毒暴露后的分子层面变化特征,为理解哮喘与呼吸道病毒感染之间的相互作用提供数据基础。

【数据集背景】

哮喘是一种常见的呼吸系统疾病,其气道上皮在结构与环境刺激响应方面具有特殊性。呼吸道病毒感染,尤其是鼻病毒感染,常被认为是诱发哮喘急性加重的重要因素之一。该数据集以分化的哮喘人气道上皮培养物为研究对象,关注其在鼻病毒感染后的表型反应,试图从基因表达差异的角度揭示这一过程中的生物学变化。数据集归属于呼吸系统疾病 / 哮喘分类,来源站为 ebi.ac.uk,并在 EBI Expression Atlas 中作为差异表达实验进行组织与呈现。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Differential,表明其内容属于差异表达实验类型。源站描述指出,该实验的物种为 Homo sapiens,研究内容为分化的哮喘人气道上皮培养物对鼻病毒的表型反应。数据集英文名称同样明确指向“Phenotypic responses of differentiated asthmatic human airway epithelial cultures to rhinovirus”。除上述信息外,关于具体样本数量、基因数量、差异表达基因列表、统计阈值、实验分组细节等内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,属于 EBI Expression Atlas 中的实验数据。源站将其描述为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens。其研究材料为分化的哮喘人气道上皮培养物,处理因素为鼻病毒感染,观察目标为表型反应。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体培养条件、病毒株类型、感染剂量与时间点等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病特别是哮喘相关的研究场景,可用于探索哮喘气道上皮在鼻病毒感染后的差异表达特征。其差异表达实验属性使其适合用于比较不同条件下的基因表达变化,帮助研究者关注病毒暴露与哮喘气道上皮反应之间的分子关联。此外,该数据集也可作为 EBI Expression Atlas 中相关实验的组成部分,用于跨数据集的表达模式比较或作为哮喘与呼吸道病毒感染研究的参考数据。关于具体分析流程、推荐工具或下游应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取,并属于 EBI Expression Atlas 中的差异表达实验。使用者可依据 Expression Atlas 的常规访问方式浏览该实验,并结合其差异表达主题标签进行查询与分析。关于数据下载格式、文件结构、预处理步骤、标准化方法、分析参数设置等具体使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,属于差异表达实验,物种为 Homo sapiens,研究主题为分化的哮喘人气道上皮培养物对鼻病毒的表型反应。其分类为呼吸系统疾病 / 哮喘,主题标签为 Differential。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量大小、重复性、统计显著性阈值、覆盖度、潜在偏倚以及验证实验等信息,源站未提供。因此,在使用该数据集时,应结合其来源与实验类型理解其适用范围,并注意源站未提供的细节可能影响解释的完整性。

【引用与许可】

该数据集英文名称为 E-GEOD-61141: Phenotypic responses of differentiated asthmatic human airway epithelial cultures to rhinovirus,来源站为 ebi.ac.uk,属于 EBI Expression Atlas 实验。关于引用方式、许可协议、使用限制、作者信息、发表文献及数据共享政策等内容,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-61141

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Phenotypic responses of differentiated asthmatic human airway epithelial cultures to rhinovirus

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