非洲裔美国哮喘儿童整合基因组分析数据：3个与肺功能相关的新位点
支气管扩张剂药物常用于治疗和管理哮喘等疾病伴随的阻塞性肺功能。给予支气管扩张剂药物后，通过肺功能测试测量的肺功能可部分或完全恢复
基本信息
资源简介
非洲裔美国哮喘儿童整合基因组分析数据：3个与肺功能相关的新位点
该数据集英文名为“Data from: Integrative genomic analysis in African American children with asthma finds 3 novel loci associated with lung function”，归类于呼吸系统疾病中的哮喘方向，来源站为 doi.org，由 Dryad 机构发布，发布时间为 2020 年，采用 Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可，主题标签为 FOS: Medical and health sciences。数据集围绕非洲裔美国哮喘儿童展开，整合基因组分析以考察与肺功能相关的遗传位点，研究共纳入 1,103 名受试者，来自“Study of African Americans, Asthma, Genes, and Environment（SAGE）”这一儿童哮喘病例对照队列。作者包括 Goddard, Pagé、Keys, Kevin、Mak, Angel、Lee, Eunice、Liu, Amy、Samedy-Bates, Lesly-Anne、Risse-Adams, Oona、Contreras, Maria、Elhawary, Jennifer、Hu, Donglei、Oh, Sam、Salazar, Sandra、Eng, Celeste、Himes, Blanca 等。
【数据集背景】
支气管扩张剂药物常用于治疗和管理哮喘等疾病伴随的阻塞性肺功能。给予支气管扩张剂药物后，通过肺功能测试测量的肺功能可部分或完全恢复。源站描述指出，用药前基线肺功能指标的遗传学已被广泛研究，支气管扩张剂反应本身的遗传学也受到一定关注，但针对用药后肺功能（post-bronchodilator lung function）的遗传学研究较少。该数据集正是为填补这一空白而产生，其研究对 SAGE 队列中 1,103 名受试者的肺功能表型进行了分析。
【数据内容】
数据集的核心内容是针对非洲裔美国哮喘儿童肺功能表型的整合基因组分析结果，研究发现了 3 个与肺功能相关的新位点。分析采用了整合基因组学方法，结合了基因型信息、位点特异性遗传祖先信息以及功能注释信息。源站描述在此处未完整给出后续内容，具体数据文件构成、变量列表与记录数量等细节源站未提供。
【采集与来源】
数据来自“Study of African Americans, Asthma, Genes, and Environment（SAGE）”儿童哮喘病例对照队列，共纳入 1,103 名受试者。研究关注的表型为肺功能测量，涉及支气管扩张剂用药前后的肺功能指标。数据经 Dryad 机构发布，来源站为 doi.org。更详细的采集流程、测量设备与随访安排源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集适用于研究哮喘患者支气管扩张剂用药后肺功能的遗传基础，尤其是非洲裔美国儿童人群；可用于结合基因型、位点特异性遗传祖先与功能注释信息的整合基因组分析，也可用于探讨基线肺功能与支气管扩张剂反应之外、用药后肺功能这一相对少被关注的表型。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、文件格式、分析流程与软件要求等均未在已有信息中说明。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、缺失值处理、样本代表性或研究局限性的具体说明。已知研究人群为非洲裔美国儿童哮喘病例对照队列，受试者数量为 1,103 名，其他限制条件源站未提供。
【引用与许可】
数据集发布于 2020 年，发布机构为 Dryad，许可为 Creative Commons Zero v1.0 Universal。引用时应使用数据集英文名“Data from: Integrative genomic analysis in African American children with asthma finds 3 novel loci associated with lung function”，并列出上述作者。更详细的引用格式与版本信息源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5061/dryad.w3r2280nw
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 6.32 GB。
数据说明
支气管扩张剂药物常用于治疗和管理哮喘等疾病中存在的阻塞性肺功能。给予支气管扩张剂药物可部分或完全恢复通过肺功能测试测量的肺功能。对使用支气管扩张剂药物前所测基线肺功能的遗传学已进行了广泛研究，而支气管扩张剂反应本身的遗传学也受到了一定关注。然而，很少有研究关注使用支气管扩张剂后肺功能的遗传学。为填补这一空白，我们采用整合基因组分析方法，结合基因型、位点特异性遗传祖先和功能注释信息，分析了来自非裔美国人哮喘、基因与环境研究（SAGE）这一儿童哮喘病例对照队列的1,103名受试者的肺功能表型。我们将全基因组关联研究（GWAS）结果与对同一受试者使用沙丁胺醇支气管扩张剂前后进行的三项肺功能测试（FEV1、FVC和FEV1/FVC）的混合映射扫描相结合，共产生六个性状。
我们确定了18个GWAS位点，以及通过混合映射发现的5个额外位点，这些位点涵盖了多个已知和新发现的肺功能候选基因。通过混合映射鉴定的大多数位点在所基因分型的全球人群中显示出次要等位基因频率的广泛变异。功能精细映射揭示了来自外周血单核细胞、胎儿肺组织和肺成纤维细胞的表观遗传注释的富集。我们的结果指出了三个新的潜在遗传驱动因素，分别影响支气管扩张剂使用前后肺功能：ADAMTS1、RAD54B和EGLN3。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
