基于基因型分层GWAS识别的日本人饮酒遗传结构及其对食管癌风险的影响

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.tmpg4f546

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 14.17 GB。

数据说明

乙醛脱氢酶2（ALDH2 rs671，G>A）的东亚特异性变异是饮酒行为的主要遗传决定因素。我们对175,672名日本个体进行了按rs671基因型分层的饮酒全基因组关联研究荟萃分析，以探索rs671与饮酒行为相关的基因-基因交互作用。该分析在野生型纯合子中鉴定出三个全基因组显著位点（GCKR、KLB和ADH1B），在杂合子中鉴定出六个位点（GCKR、ADH1B、ALDH1B1、ALDH1A1、ALDH2和GOT2），其中五个位点与rs671存在全基因组显著的交互作用。遗传相关性分析揭示了杂合子中祖先特异性的遗传结构。在所发现的位点中，有四个（GCKR、ADH1B、ALDH1A1和ALDH2）被提示与rs671在食管癌（一种代表性的酒精相关疾病）风险中存在交互作用。我们的结果揭示了饮酒的基因型特异性遗传结构，并揭示了其对酒精相关疾病风险的潜在影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。