靶向降解Brachyury破坏脊索瘤细胞身份特异性自调控程序的RNA测序数据集
该数据集包含脊索瘤细胞的总RNA测序和SLAM-seq数据，涵盖转录因子brachyury降解与转录CDK抑制条件下的基因表达变化，属于多模态的转录组学数据，主要用于研究脊索瘤中brachyury的自调控网络、细胞身份维持机制以及靶向治疗策略的探索。
![Targeted brachyury degradation disrupts a highly specific autoregulatory program controlling chordoma cell identity [Total RNA-seq, SLAM-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/4090.jpg)
基本信息
资源简介
靶向降解Brachyury破坏脊索瘤细胞身份特异性自调控程序的RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Targeted brachyury degradation disrupts a highly specific autoregulatory program controlling chordoma cell identity [Total RNA-seq, SLAM-seq]》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Chordomas are rare spinal tumors addicted to expression of the developmental transcription factor brachyury. In chordomas, brachyury is super-enhancer associated and preferentially downregulated by pharmacologic transcriptional CDK inhibition, leading to cell death. To understand the underlying basis of this sensitivity, we dissect the brachyury transcription regulatory network and compare the consequences of brachyury degradation with transcriptional CDK inhibition. Brachyury defines the chordo…
【主题与分类】
主题标签：brachyury、chordoma、cyclin-dependent kinase、phase separation、super-enhancer、targeted degradation、transcription、transcription factor、transcriptional condensate、transcriptional inhibition.。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=21afff3ec8cfacfe15f22847cc94f3b4
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 33521702
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来自一项针对罕见脊柱肿瘤——脊索瘤的研究，主要探究转录因子brachyury在脊索瘤细胞身份调控中的作用。数据集包含总RNA测序（Total RNA-seq）和SLAM-seq数据，用于分析brachyury降解和转录CDK抑制对brachyury自调控网络及转录程序的影响。数据来源于Baylor College of Medicine的研究团队，通过实验方法（如药物干预和分子降解）构建，旨在揭示脊索瘤对brachyury表达的依赖性及其自调控反馈机制。该数据集主要用于脊索瘤的分子机制研究、转录调控网络分析以及靶向治疗策略的开发。
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