脊索瘤DNA甲基化模式特征性变化的表征研究数据集
该数据集包含10例脊索瘤患者的肿瘤样本基因数据，通过Affymetrix芯片和甲基化分析技术，提供了基因组不稳定性信息和DNA甲基化模式数据，涉及基因表达和表观遗传修饰等多模态信息，主要用于研究脊索瘤的表观遗传学机制、筛选早期诊断生物标志物，并探索PI3K信号通路在肿瘤发展中的作用，为罕见肿瘤的精准医疗提供数据支持。
基本信息
资源简介
脊索瘤DNA甲基化模式特征性变化的表征研究数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Chordoma Characterization of Significant Changes of the DNA Methylation Pattern》。配套论文《Chordoma Characterization of Significant Changes of the DNA Methylation Pattern》发表于 PLoS ONE（2013），DOI：10.1371/journal.pone.0056609。源站首次发布：2013-03-22。
【数据内容】
源站原始描述：Chordomas are rare mesenchymal tumors occurring exclusively in the midline from clivus to sacrum. Early tumor detection is extremely important as these tumors are resistant to chemotherapy and irradiation. Despite continuous research efforts surgical excision remains the main treatment option. Because of the often challenging anatomic location early detection is important to enable complete tumor resection and to reduce the high incidence of local recurrences. The aim of this study was to explor…
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 242.69 KB。Table_S1.doc：application/msword，53.25 KB。Table_S2.doc：application/msword，50.18 KB。Table_S3.doc：application/msword，49.66 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0056609。
【主题与分类】
源站学科分类：Cancer、Medicine、Genetics。主题标签：chordoma、characterization、dna、methylation、pattern。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cancer、Medicine、Genetics。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Chordoma_Characterization_of_Significant_Changes_of_the_DNA_Methylation_Pattern__/658003
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Rinner, Beate; Weinhaeusel, Andreas; Lohberger, Birgit; Verena Froehlich, Elke; Pulverer, Walter; Fischer, Carina; et al. (2016). Chordoma Characterization of Significant Changes of the DNA Methylation Pattern. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于罕见的中线间叶性肿瘤——脊索瘤的DNA甲基化模式研究。数据集基于10例脊索瘤患者的肿瘤样本，通过Affymetrix 6.0芯片检测基因组不稳定性，并采用AITCpG360甲基化分析方法，识别出与正常血液样本相比存在高/低甲基化的20个基因，包括C3、XIST、TACSTD2等9个关键候选基因。数据来源为临床手术切除的肿瘤组织，研究旨在探索DNA甲基化在脊索瘤发生发展中的作用，发现与单核苷酸多态性（SNP）分析相关的潜在生物标志物。主要研究方向为脊索瘤的表观遗传学机制、早期诊断生物标志物筛选以及PI3K信号通路在肿瘤进展中的潜在意义。
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