中耳胆脂瘤组织图像数据集（男性，54岁）

Name: 中耳胆脂瘤组织图像数据集（男性，54岁）
Creator: 千方医数集科研发现管道
License: CC BY 4.0

该数据集来自 plos.figshare.com，包含 1 个 Table_2.xls 文件，围绕中耳胆脂瘤相关生物学功能的激活方向提供统计预测结果

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2023-06-02 更新

蛋白质预测BiochemistryproteomicsProtein abundancecell biologyMolecular cell biologydermatologyInflammatory diseasesotorhinolaryngologyfunctions

Cholesteatoma of middle ear - Male, 54 - Tissue image [61907300173291]

基本信息

模态

蛋白质

大小

0.000005632 GB

任务类型

预测

许可

CC BY 4.0

创建/更新时间

2023-06-02

版本

资源简介

中耳胆脂瘤组织图像数据集（男性，54岁）

Activation direction of biological functions in cholesteatoma.

该数据集来自 plos.figshare.com，包含 1 个 Table_2.xls 文件，围绕中耳胆脂瘤相关生物学功能的激活方向提供统计预测结果。数据基于胆脂瘤囊、胆脂瘤颈部、鼓膜和外耳道皮肤之间的比较，依据上调和下调蛋白的组成计算功能激活方向，并列出 z 分数超过 1.645（90% 显著性水平）的生物学功能。该数据可用于胆脂瘤蛋白质组学与分子功能方向的探索性分析（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。

【数据集背景】

源站首次发布：2014-08-05。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：关于与胆脂瘤相关的生物学功能激活方向的统计预测（见实验流程）。显示预测 z 分数高于数值 1.645（90% 显著性水平）的生物学功能。第一步，基于可归属于这些功能的上调和下调蛋白，将生物学功能与胆脂瘤进行统计学关联。随后，根据这些蛋白中上调和下调的组成计算激活方向的预测。所列结果见于胆脂瘤囊（C）、胆脂瘤颈部（N）、鼓膜（T）和外耳道皮肤（S）之间的比较。*蛋白必须在两个组织中显示相同的表达方向，并至少在一个组织中满足倍数变化标准。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 5.63 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0104103.t002。

【主题与分类】

源站学科分类：Biological Sciences。主题标签：Biochemistry、proteomics、Protein abundance、cell biology、Molecular cell biology、dermatology、Inflammatory diseases、otorhinolaryngology、functions。本站分类：耳鼻咽喉疾病/胆脂瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Activation_direction_of_biological_functions_in_cholesteatoma_/1130389

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Britze, Anders; Isak Dupont Birkler, Rune; Gregersen, Niels; Ovesen, Therese; Palmfeldt, Johan (2015). Activation direction of biological functions in cholesteatoma.. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。

原始链接

https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Activation_direction_of_biological_functions_in_cholesteatoma_/1130389

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使用方式

数据集获取（Figshare）

源站标题：Activation direction of biological functions in cholesteatoma.
DOI：10.1371/journal.pone.0104103.t002
发布日期：2014-08-05
文件数：1 个
文件总体积：5.63 KB
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Activation_direction_of_biological_functions_in_cholesteatoma_/1130389

命令行下载

curl -L -o "Table_2.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/1624885"

文件清单

Table_2.xls（5.63 KB）

文件总体积 5.63 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

与胆脂瘤相关的生物学功能激活方向的统计预测（见实验程序）。图中展示了预测z分数高于数值1.645（90%显著性水平）的生物学功能。首先，根据可归属于这些功能的上下调蛋白质，将生物学功能与胆脂瘤进行统计学关联。随后，基于这些蛋白质中上下调表达的构成，计算了激活方向的预测。所列结果是在胆脂瘤囊（C）、胆脂瘤颈部（N）、鼓膜（T）和外耳道皮肤（S）之间的比较中发现的。*蛋白质必须在两种组织中显示相同的表达方向，并至少在其中一种组织中满足倍数变化标准。