前庭神经鞘瘤患者外淋巴蛋白质组数据集:探索肿瘤相关听力损失的生物标志物

该数据集是一个针对前庭神经鞘瘤患者的外淋巴蛋白质组学数据,包含15例患者术中采集的外淋巴样本,通过质谱技术鉴定出314种蛋白质,并分析了蛋白质功能及其与临床参数(如听力损失和肿瘤大小)的关联,主要用于探索内耳疾病的分子机制、发现肿瘤相关听力损失的生物标志物,以及研究前庭神经鞘瘤的病理生理过程。

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2018-06-01 更新
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蛋白质组学生物标志物发现前庭神经鞘瘤听力损失机制

基本信息

创建/更新时间
2018-06-01

资源简介

该数据集是一个针对前庭神经鞘瘤(听神经瘤)患者的外淋巴蛋白质组学研究数据集。数据集包含15例接受经迷路手术的患者在术中通过圆窗采集的外淋巴样本,使用在线串联LTQ-Orbitrap质谱仪进行分析,并通过MaxQuant软件进行蛋白质鉴定和定量。共鉴定出314种蛋白质,其中60种在所有患者中均存在,130种仅在个别患者中出现。数据集重点分析了蛋白质功能(使用PANTHER富集工具)以及蛋白质含量与临床参数(特别是肿瘤相关听力损失和肿瘤直径)之间的关联。通过随机森林和Boruta分析发现,α-2-HS-糖蛋白(P02765)是肿瘤相关听力损失的独立变量。该数据集主要用于探索内耳疾病的分子机制、发现听力损失的潜在生物标志物,以及研究前庭神经鞘瘤的病理生理过程。

原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/The_proteome_of_perilymph_in_patients_with_vestibular_schwannoma_A_possibility_to_identify_biomarkers_for_tumor_associated_hearing_loss_/6404525

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数据说明

该数据集是一个针对前庭神经鞘瘤(听神经瘤)患者的外淋巴蛋白质组学研究数据集。数据集包含15例接受经迷路手术的患者在术中通过圆窗采集的外淋巴样本,使用在线串联LTQ-Orbitrap质谱仪进行分析,并通过MaxQuant软件进行蛋白质鉴定和定量。共鉴定出314种蛋白质,其中60种在所有患者中均存在,130种仅在个别患者中出现。数据集重点分析了蛋白质功能(使用PANTHER富集工具)以及蛋白质含量与临床参数(特别是肿瘤相关听力损失和肿瘤直径)之间的关联。通过随机森林和Boruta分析发现,α-2-HS-糖蛋白(P02765)是肿瘤相关听力损失的独立变量。该数据集主要用于探索内耳疾病的分子机制、发现听力损失的潜在生物标志物,以及研究前庭神经鞘瘤的病理生理过程。

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