PXD000013:报告离子定量蛋白质组学整体定量准确度评估(iQUARI)
源站描述指出,该研究关注基于报告离子定量中的MS1干扰问题,并借助正交蛋白质组——人(Human)与 Pyrococcus furiosus——开展相关研究

基本信息
资源简介
PXD000013:报告离子定量蛋白质组学整体定量准确度评估(iQUARI)
PXD000013(iQUARI)是一个与报告离子定量蛋白质组学准确度评估相关的数据集,其英文名称包含“Integral quantification accuracy estimation for reporter ion-based quantitative proteomics”,来源自 ebi.ac.uk。
【数据集背景】
源站描述指出,该研究关注基于报告离子定量中的MS1干扰问题,并借助正交蛋白质组——人(Human)与 Pyrococcus furiosus——开展相关研究。iQUARI 名称中的 Integral quantification accuracy estimation 表明其目标与报告离子定量准确度评估相关。报告离子定量(如 iTRAQ)是蛋白质组学中常见的相对定量策略,MS1 干扰可能影响定量准确性;该数据集即围绕这一问题展开。关于该研究的具体实验设计、样本数量、分组方式、是否包含标准品、干扰设置等,源站未提供。
【数据内容】
从已有信息看,该数据集与人类和 Pyrococcus furiosus 两种正交蛋白质组相关,并涉及 iTRAQ 标记。随数据记录出现的主题词汇包括 Human、Pyrococcus furiosus、Itraq,以及 NEWT 本体中的人类(Homo sapiens,NEWT:9606)等条目。源站未提供原始文件列表、文件格式、质谱原始数据规模、结果表、鉴定数量、定量蛋白数或肽段数等具体内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述为“Study on the MS1 interference problem for reporter ion quantification using orthogonal proteomes: human and pyrococcus furiosus.”。除来源站和上述描述外,源站未提供样本制备、质谱平台、色谱条件、采集参数、实验地点或提交者等采集细节。
【适用场景】
根据源站描述,该数据集适合与报告离子定量、iTRAQ 标记、MS1 干扰问题以及正交蛋白质组混合体系相关的研究场景建立关联。对于关注定量准确度评估、干扰效应分析或跨物种蛋白质组混合实验的研究者,该数据集可能具有参考价值。源站未提供其明确推荐用途、适用分析流程或配套工具说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括下载步骤、文件组织方式、推荐搜索软件、定量软件、参数设置或复现流程。需要使用者自行查阅来源站 PXD000013 页面及相关研究资料。本站分类为其他/其他,也未见针对该数据集的专门使用说明。
【质量与限制】
源站未提供质量评估指标、数据完整性说明、技术重复或生物学重复信息、缺失值情况、定量准确性数值、误差范围或其他质量控制结论。由于缺少这些信息,无法依据现有内容判断其数据质量水平、覆盖范围或适用边界。已知限制是:现有信息仅能确认数据集名称、来源、源站描述以及若干主题词,不能支持对实验规模、数据构成和分析结果的进一步说明。
【引用与许可】
源站未提供许可协议、使用条款、引用格式、DOI、PubMed 标识或作者列表。若需引用或使用,应前往 ebi.ac.uk 上对应的 PXD000013 记录页面核实最新许可与引用要求。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000013
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
使用正交蛋白质组(人类与激烈火球菌)研究报告离子定量中的MS1干扰问题。
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