Andrews、Kukkle、Menon 等印度帕金森病 GWAS 汇总统计

该数据集为 Andrews、Kukkle、Menon 等人关于印度青少年、青年及早发型帕金森病遗传驱动因素研究的 GWAS 汇总统计,包含帕金森病诊断 GWAS 与发病年龄 GWAS 两个文件,基因组坐标基于 hg38,结果已按 MAF > 0.05 和插补质量 DR2 > 0.9 过滤

Denali TherapeuticsDenali Therapeutics
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2023-10-20 更新
浏览 4
基因组回归GWASParkinson's DiseaseGeneticsSouth AsiaIndia
Summary stats for Andrews, Kukkle, Menon et al. Indian Parkinson's Disease GWAS

基本信息

模态
基因组
大小
0.217318551 GB
任务类型
回归
许可
cc-by-nc-nd-4.0
创建/更新时间
2023-10-20

资源简介

Andrews、Kukkle、Menon 等印度帕金森病 GWAS 汇总统计

Summary stats for Andrews, Kukkle, Menon et al. Indian Parkinson's Disease GWAS

该数据集为 Andrews、Kukkle、Menon 等人关于印度青少年、青年及早发型帕金森病遗传驱动因素研究的 GWAS 汇总统计,包含帕金森病诊断 GWAS 与发病年龄 GWAS 两个文件,基因组坐标基于 hg38,结果已按 MAF > 0.05 和插补质量 DR2 > 0.9 过滤。数据可用于帕金森病遗传关联分析、发病年龄相关变异探索及南亚人群遗传研究(来源 Zenodo,cc-by-nc-nd-4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-10-13。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Andrews、Kukkle、Menon 等人“The genetic drivers of juvenile, young, and early-onset Parkinson's Disease in India”研究的 GWAS 汇总统计。基因组坐标基于 hg38。结果已按 MAF > 0.05 和插补质量(DR2)> 0.9 过滤。PDDiagnosis_GWAS.txt.gz - 帕金森病诊断 GWAS 汇总统计 CHR:染色体 BP:碱基对位置 A1:效应等位基因 A2:替代等位基因 BETA:比值比(相对于 A1) SE:标准误 L95:置信区间下界 U95:置信区间上界 STAT:T 统计量 P:p 值 MAF:效应等位基因频率 MAF.cases:病例中效应等位基因频率(注意:可能超过 0.5) MAF.cont:对照中效应等位基因频率(注意:可能超过 0.5) DR2:Beagle 插补质量指标 AgeofOnset_GWAS.txt.gz - 发病年龄 GWAS 汇总统计 CHR:染色体 BP:碱基对位置 A1:效应等位基因 A2:替代等位

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 217.32 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.8436983。

【主题与分类】

主题标签:GWAS、Parkinson's Disease、Genetics、South Asia、India。本站分类:神经系统疾病/帕金森病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/8436983

使用许可:cc-by-nc-nd-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-10-20,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

curl -L -o "AgeofOnset_GWAS.txt.gz" "https://zenodo.org/api/records/8436983/files/AgeofOnset_GWAS.txt.gz/content"
curl -L -o "PDDiagnosis_GWAS.txt.gz" "https://zenodo.org/api/records/8436983/files/PDDiagnosis_GWAS.txt.gz/content"

文件清单

  • AgeofOnset_GWAS.txt.gz(68.8 MB)
  • PDDiagnosis_GWAS.txt.gz(138.4 MB)

数据集大小约 217.3 MB。

数据说明

Andrews、Kukkle、Menon等人“印度青少年、年轻及早发性帕金森病的遗传驱动因素”研究的GWAS汇总统计数据。基因组坐标基于hg38。结果已按MAF > 0.05及插补质量(DR2)> 0.9进行过滤。PDDiagnosis_GWAS.txt.gz——帕金森病诊断GWAS的汇总统计数据 CHR:染色体 BP:碱基对位置 A1:效应等位基因 A2:替代等位基因 BETA:比值比(相对于A1) SE:标准误 L95:置信区间下限 U95:置信区间上限 STAT:T统计量 P:p值 MAF:效应等位基因频率 MAF.cases:病例中效应等位基因频率(注:可能超过0.5) MAF.cont:对照中效应等位基因频率(注:可能超过0.5) DR2:Beagle插补质量指标 AgeofOnset_GWAS.txt.gz——发病年龄GWAS的汇总统计数据 CHR:染色体 BP:碱基对位置 A1:效应等位基因 A2:替代等位基因 BETA:回归系数(相对于A1) SE:标准误 L95:置信区间下限 U95:置信区间上限 STAT:T统计量 P:p值 MAF:效应等位基因频率 DR2:Beagle插补质量指标

许可

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