MESA肺部影像研究数据集

MESA Lung 数据集包含多种族人群的胸部CT影像与肺功能数据,用于分析早期肺部损伤及细支气管相关病理变化。

NHLBINHLBI
dbGaP
2022-01-01 更新
浏览 39
多模态分类AtherosclerosisCardiovascular DiseaseMulti-EthnicCohortdbGaPGeneticsCTMRIUltrasoundECG
MESA Lung Study

基本信息

模态
多模态
大小
600 GB
数据量
5000
任务类型
分类
许可
dbGaP controlled-access
创建/更新时间
2022-01-01

资源简介

MESA肺部影像研究数据集

【一句话概览】

多民族动脉粥样硬化研究(MESA)旨在探讨亚临床心血管疾病特征及其进展为临床心血管疾病的预测风险因素。研究纳入美国六个现场中心招募的6814名45至84岁无症状男女,其中白人占38%、非裔28%、西班牙裔22%、亚裔12%(以华裔为主)。参与者接受全面体检及冠脉钙化、心室质量与功能、内皮功能、颈动脉壁厚度等多项亚临床指标检测,并随访心血管事件、干预及死亡情况。血液样本已检测生化风险因素并储存,DNA已提取用于遗传学研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis (MESA) Cohort》。

【数据内容】

源站原始描述:The Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis (MESA) is a study of the characteristics of subclinical cardiovascular disease (disease detected non-invasively before it has produced clinical signs and symptoms) and the risk factors that predict progression to clinically overt cardiovascular disease or progression of the subclinical disease. MESA researchers study a diverse, population-based sample of 6,814 asymptomatic men and women aged 45-84. Thirty-eight percent of the recruited participants are w…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):动脉粥样硬化的多种族研究(MESA)是一项关于亚临床心血管疾病(在产生临床体征和症状之前通过无创手段检测到的疾病)特征以及预测其进展为临床显性心血管疾病或亚临床疾病进展的危险因素的研究。MESA研究人员研究了一个多样化、基于人群的样本,共纳入6,814名年龄在45至84岁之间的无症状男性和女性。招募的参与者中38%为白人,28%为非裔美国人,22%为西班牙裔,12%为亚裔,其中以华裔为主。参与者从美国六个现场中心招募:维克森林大学、哥伦比亚大学、约翰斯·霍普金斯大学、明尼苏达大学、西北大学和加利福尼亚大学洛杉矶分校。每位参与者均接受了全面的体格检查,并测定了冠状动脉钙化、心室质量和功能、血流介导的内皮血管舒张、颈动脉内膜中层厚度及颈动脉内回声透亮区的存在、下肢血管功能不全、动脉波形、心电图(ECG)测量指标、标准冠状动脉危险因素、社会人口学因素、生活方式因素和心理社会因素。在随访访视中选择性重复亚临床疾病测量和危险因素评估,有助于研究疾病的进展。血液样本已检测推定的生化危险因素,并储存用于病例对照研究。DNA已被提取,淋巴细胞已冷冻保存(以备可能的永生化),用于候选基因研究,并可能用于全基因组扫描、表达及其他遗传学技术。参与者正在接受随访,以识别和描述心血管疾病事件,包括急性心肌梗死和其他形式的冠心病(CHD)、卒中及充血性心力衰竭;心血管疾病干预措施;以及死亡率。除六个现场中心外,MESA还包括一个协调中心、一个中心实验室,以及计算机断层扫描(CT)、磁共振成像(MRI)、超声和心电图(ECG)的中心判读中心。方案制定、人员培训和试点测试在研究的前18个月内完成。第一次检查

【主题与分类】

主题标签:Atherosclerosis、Cardiovascular Disease、Multi-Ethnic、Cohort、dbGaP、Genetics、CT、MRI、Ultrasound、ECG。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000209.v13.p3

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000209.v13.p3

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 600.00 GB。

数据说明

MESA Lung 是多种族动脉粥样硬化研究中的肺部子队列数据集,包含胸部CT影像、肺功能检测及环境暴露信息,用于研究亚临床肺疾病及细支气管功能损伤。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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