帕金森病痴呆扣带回皮层肌氨酸不溶性组分的单颗粒冷冻电镜数据集 -synuclein 纤维
EMPIAR-11140 来自一名帕金森病痴呆患者扣带回皮层肌氨酸不溶性组分的单颗粒冷冻电镜数据集 -synuclein 纤维 1.2 来自帕金森病痴呆显微照片的 α-synuclein 纤维冷冻电镜重建 - 多帧 TIFF 10874
基本信息
资源简介
帕金森病痴呆扣带回皮层肌氨酸不溶性组分的单颗粒冷冻电镜数据集 -synuclein 纤维
EMPIAR-11140 是一个单颗粒冷冻电镜数据集，来源于一名帕金森病痴呆患者的扣带回皮层。该数据集聚焦于肌氨酸不溶性组分中的 α-synuclein 纤维，包含冷冻电镜重建结果以及相关的多帧 TIFF 显微照片数据，共 10874 个文件。数据集英文名称为 Single particle cryo-EM dataset of sarkosyl-insoluble fraction from the cingulate cortex of an individual with Parkinson's disease dementia -synuclein filaments。该资源属于神经系统疾病 / 帕金森病分类，来源站为 ebi.ac.uk，可为研究帕金森病痴呆中 α-synuclein 纤维结构提供冷冻电镜层面的数据支持。
【数据集背景】
该数据集来自一名帕金森病痴呆患者。帕金森病痴呆是帕金森病相关的神经系统疾病，其病理特征常涉及 α-synuclein 蛋白的异常聚集。本数据集所关注的样本为扣带回皮层的肌氨酸不溶性组分，这一组分通常用于富集不溶性蛋白聚集体，包括 α-synuclein 纤维。数据集名称明确指向“单颗粒冷冻电镜数据集”，说明其技术路线为单颗粒冷冻电镜分析，目标结构为 α-synuclein 纤维。源站描述中提及“EMPIAR-11140”，表明该数据集在 EMPIAR 中登记，编号为 11140。该数据集所属分类为神经系统疾病 / 帕金森病，来源站为 ebi.ac.uk。
【数据内容】
数据集包含单颗粒冷冻电镜数据，具体包括 α-synuclein 纤维的冷冻电镜重建结果，以及来自帕金森病痴呆显微照片的多帧 TIFF 文件。源站描述中写明“1.2 Cryo-EM reconstruction of alpha-synuclein filaments from Parkinson's disease dementia micrographs - multiframe TIFF 10874”，说明该数据集包含 10874 个多帧 TIFF 文件，这些文件与帕金森病痴呆显微照片相关，并用于 α-synuclein 纤维的冷冻电镜重建。数据集名称中的“-synuclein filaments”与源站描述中的“alpha-synuclein filaments”对应，均指 α-synuclein 纤维。数据内容围绕扣带回皮层肌氨酸不溶性组分中的 α-synuclein 纤维展开，属于单颗粒冷冻电镜结构分析数据。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，源站描述中标注为 EMPIAR-11140。样本来源为一名帕金森病痴呆患者的扣带回皮层，经过肌氨酸不溶性组分提取。采集技术为单颗粒冷冻电镜，数据形式包括显微照片的多帧 TIFF 文件以及冷冻电镜重建结果。源站描述中提及“micrographs - multiframe TIFF 10874”，表明显微照片以多帧 TIFF 格式提供，文件数量为 10874。关于具体的采集设备、放大倍数、像素尺寸、总剂量、曝光时间、帧数等参数，源站未提供。关于样本制备的详细步骤、肌氨酸不溶性组分的提取流程、冷冻制样条件等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与帕金森病痴呆相关的 α-synuclein 纤维结构研究。由于数据为单颗粒冷冻电镜数据集，可用于分析 α-synuclein 纤维的冷冻电镜重建结果，也可用于处理来自帕金森病痴呆显微照片的多帧 TIFF 数据。适用场景包括但不限于：研究扣带回皮层肌氨酸不溶性组分中 α-synuclein 纤维的形态与结构特征；比较或参考帕金森病痴呆相关 α-synuclein 纤维的冷冻电镜数据；作为单颗粒冷冻电镜图像处理流程的输入数据，用于颗粒挑选、二维分类、三维重建等常规分析步骤。该数据集分类为神经系统疾病 / 帕金森病，因此也适用于神经系统疾病特别是帕金森病相关病理机制的研究背景。关于具体的研究结论或生物学解释，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取，登记编号为 EMPIAR-11140。数据形式包括多帧 TIFF 显微照片和冷冻电镜重建结果。使用者可按照单颗粒冷冻电镜常规流程使用这些数据，例如对多帧 TIFF 文件进行帧对齐、剂量加权、CTF 估计、颗粒挑选、二维分类、三维重建和结构解析等。由于源站描述中提及“1.2 Cryo-EM reconstruction”，说明数据集中包含重建结果，使用者可将其作为参考或用于后续分析。关于具体软件、参数设置、数据处理步骤、文件组织方式、下载方式等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于一名帕金森病痴呆患者的扣带回皮层，属于单病例样本，因此其代表性可能限于该个体。数据包含 10874 个多帧 TIFF 文件，文件数量较多，但关于图像质量、分辨率、信噪比、各向异性、颗粒数量、取向分布、重建分辨率等具体质量指标，源站未提供。该数据集为单颗粒冷冻电镜数据，可能受限于冷冻电镜技术本身的常见问题，如颗粒取向优势、构象异质性、辐射损伤等，但源站未提供针对该数据集的具体质量评估。关于数据是否经过验证、是否存在缺失文件、是否有重复或低质量图像等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集登记于 EMPIAR，编号为 EMPIAR-11140，来源站为 ebi.ac.uk。关于引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时，应参考来源站 ebi.ac.uk 上 EMPIAR-11140 的官方页面以获取准确的引用与许可信息。关于数据集的作者列表、发表文献、资助信息等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-11140
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMPIAR-11140 帕金森病痴呆患者扣带皮层肌氨酸不溶性组分的单颗粒冷冻电镜数据集 - α-突触核蛋白纤维 1.2 帕金森病痴呆显微图像中α-突触核蛋白纤维的冷冻电镜重建 - 多帧TIFF 10874
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
