PXD014515：脑脊液中血液污染及其对α-突触核蛋白定量分析的影响

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD014515

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑脊液（CSF）分析对神经系统疾病的诊断很重要。可对从中枢神经系统（CNS）释放的特定蛋白进行定量监测。尤其是在神经退行性疾病领域，异常蛋白丰度是一种重要的生物标志物。然而，CSF 样本质量是分析结果的关键因素。在本研究中，我们评估了 CSF 中血液污染对蛋白质生物标志物鉴定的影响。我们比较了三种不同的检测方法：用于尿血红蛋白的半定量 Combur10-Test® 试纸条、特异性血红蛋白 ELISA，以及基于自下而上质谱（MS）的蛋白质组学，以测定总体血液污染水平。同时，我们研究了血液污染对 α-突触核蛋白（aSyn）可检测性的影响；aSyn 是血液/红细胞中高丰度蛋白，也是帕金森病的潜在生物标志物。基于我们的结果，我们确定了血红蛋白以外的其他血液污染标志物，并定义了 CSF 样本中血液水平的分级系统，包括基于质谱的生物标志物研究可耐受的血液污染下限，并建议将 Combur10-Test® 作为一种经济有效的检测方法，用于简单、快速地测定 CSF 中的血液污染。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。