PXD002424：人脑脊液外泌体，液相色谱-串联质谱

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002424

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从视神经脊髓炎患者脑脊液中分离的外泌体进行定量蛋白质组学分析，检测到能够与多发性硬化和特发性长节段横贯性脊髓炎相区分的潜在特异性疾病标志物。采用差速离心从汇集脑脊液中以高纯度富集外泌体。样本汇集策略包括按细胞因子水平进行预分类；当高细胞因子亚组相互比较时，该策略通过提供更高的倍数变化比和更低的 p 值，改善了靶分子鉴定。除质谱谱图计数和非标记定量外，还通过 UPLC 以及 Orbitrap 或 Q-Exactive Hybrid Quadrupole-Orbitrap 仪器进行串联质谱分析，完成了正交定量验证。包含 442 个显著外泌体蛋白的蛋白质组学数据集检测到推定的疾病特异性生物标志物，即分别为视神经脊髓炎的胶质纤维酸性蛋白和多发性硬化的纤连蛋白。对胶质纤维酸性蛋白和纤连蛋白表达的进一步研究显示，经流式细胞术检测，它们存在于完整外泌体中。对单个样本中胶质纤维酸性蛋白的 ELISA 检测通过将疾病组适当聚类，证明了其诊断适用性。来自非标记定量的目标分子表达水平与 Western blotting 的结果高度一致。最后，对已鉴定蛋白进行的 MetaCore 通路分析支持这些蛋白通过参与神经通路而参与疾病进展。这项全面研究表明，脑脊液外泌体蛋白质组学方法可用于中枢神经系统炎性疾病的识别和表征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。