PRJNA1450066：纳米酶治疗α-突触核蛋白病小鼠模型的RNA-seq分析
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1450066），主题为纳米酶治疗α-突触核蛋白病小鼠模型的 RNA-seq 分析，属于神经系统疾病/帕金森病方向
基本信息
资源简介
PRJNA1450066：纳米酶治疗α-突触核蛋白病小鼠模型的RNA-seq分析
该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项 RNA-seq 研究项目，英文名称为“PRJNA1450066: RNA-seq analysis of alpha-synucleinopathy mouse models with nanozyme treatment”，源站编号为 ID 1450066。项目主题聚焦于纳米酶治疗α-突触核蛋白病小鼠模型后的 RNA-seq 分析，在分类上归属于神经系统疾病中的帕金森病方向。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将同一项研究计划所产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找和访问。该项目的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其数据内容以原始序列读段为主。整体而言，该数据集为研究α-突触核蛋白病及纳米酶干预机制提供了转录组层面的原始测序数据资源。
【数据集背景】
α-突触核蛋白病是一类以α-突触核蛋白异常聚集为特征的神经系统疾病，帕金森病是其中最具代表性的类型之一。围绕该类疾病的小鼠模型开展转录组研究，有助于从基因表达层面观察疾病相关变化以及干预手段的潜在影响。该数据集所属的 BioProject 项目正是以纳米酶治疗α-突触核蛋白病小鼠模型为研究对象，通过 RNA-seq 分析获取转录组数据。BioProject 记录本身提供了一个集中入口，使用户能够找到该项目所产生的各类相关数据。该项目的分类归属为神经系统疾病 / 帕金森病，主题标签为原始序列读段。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其核心数据为 RNA-seq 产生的原始序列读段。数据来源于对接受纳米酶治疗的α-突触核蛋白病小鼠模型所进行的 RNA-seq 分析。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等具体内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站编号为 ID 1450066。BioProject 是来自单一机构或联盟的、与单一研究计划相关的生物数据集合，其记录为用户提供查找该项目所生成多种数据类型的统一位置。该项目的英文名称为“PRJNA1450066: RNA-seq analysis of alpha-synucleinopathy mouse models with nanozyme treatment”。关于样本采集地点、采集时间、实验操作流程、测序机构等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与α-突触核蛋白病、帕金森病相关的转录组研究场景，尤其是围绕纳米酶治疗小鼠模型所开展的 RNA-seq 分析。研究人员可将其用于探索纳米酶干预下基因表达层面的变化，也可作为神经系统疾病动物模型转录组研究的原始数据资源。由于主题标签为原始序列读段，该数据可用于需要从原始读段起步的再分析流程。关于更具体的适用场景说明，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供访问入口，用户可通过 NCBI BioProject 查找该项目所关联的多种数据类型。由于主题标签为原始序列读段，使用时可围绕原始测序读段开展后续分析。关于具体的下载方式、数据处理步骤、分析工具与参数设置等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物数据项目记录。其主题标签为原始序列读段，意味着数据以未经过高级处理的原始读段形式呈现，使用前通常需要自行完成质控与后续分析。关于数据质量评分、覆盖度、批次效应、样本量充分性等具体质量指标，源站未提供。关于该数据集在适用范围、分辨率或结论外推方面的限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站编号为 ID 1450066。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或授权要求等具体信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1450066
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
α-突触核蛋白病，包括帕金森病及相关疾病，其特征是与蛋白聚集和神经炎症相关的进行性神经退行性变。尽管氧化应激已被广泛认为与疾病进展有关，但硝化应激和活性氮物种（RNS）在调节α-突触核蛋白病理中的作用仍不完全清楚。在本研究中，我们利用具有不同催化特性的工程化铱基纳米酶，探讨了氧化还原失衡对α-突触核蛋白驱动的神经退行性变的机制性贡献。具体而言，我们将一种促进一氧化氮衍生RNS生成的铜调控Ir3Cu纳米酶，与一种具有广泛活性氧和活性氮物种清除活性的无铜铱纳米酶进行了比较。为确定与疾病进展及纳米酶介导调节相关的转录变化，我们对在多种实验条件下从α-突触核蛋白病小鼠模型收集的脑组织进行了批量RNA测序，这些条件包括溶媒处理对照、铱纳米酶处理以及Ir3Cu纳米酶暴露。
这些模型包括预成型纤维（PFF）诱导的α-突触核蛋白病理，使得能够在体内评估神经退行性和神经炎症反应。对RNA测序数据进行分析，以识别与硝化应激、免疫激活和神经退行性变相关的差异表达基因和通路。特别关注与一氧化氮信号传导、诱导型一氧化氮合酶（iNOS）以及与该DNA损伤和PARP1激活相关的下游分子事件有关的通路。这些数据为了解α-突触核蛋白病理背后的转录程序提供了全面的资源，并将硝化应激确立为神经退行性过程的关键驱动因素。此外，该数据集为氧化还原调节纳米材料如何影响神经炎症和疾病提供了见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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