对称与非对称帕金森病患者肠道与口腔微生物组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1394324

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：帕金森病（PD）在临床上表现出相当大的异质性，尤其是在运动症状对称性方面。本研究探讨对称型与不对称型PD患者在肠道和口腔微生物群方面可能存在的差异，为不同致病机制的假说提供微生物学证据。样本信息：该数据集包含53例PD患者的微生物组图谱，临床分层为30例对称型和23例不对称型病例。每位参与者均采集了配对的粪便和唾液样本。方法：采用Illumina平台上的16S rRNA基因测序进行微生物群落分析。生物信息学处理包括质量控制、OTU/ASV挑选、分类学注释以及下游统计分析，以比较两个PD亚组之间的多样性和差异类群丰度。关键发现：该数据集揭示了不同的肠道和口腔微生物群落结构。

值得注意的是，对称性帕金森病与特定类群的富集相关，如Desulfobacterota，其与临床严重程度评分呈正相关。数据用途：该数据集可作为探索帕金森病异质性中肠-脑和口-脑轴的资源。它支持对帕金森病亚型分型的微生物生物标志物以及微生物群在疾病机制中作用的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。