黑质神经黑色素颗粒蛋白质组图谱：与酪氨酸羟化酶、应激颗粒及溶酶体的关联

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD033533

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

神经黑色素是一种黑褐色色素，存在于黑质致密部多巴胺能神经元胞体中被称作神经黑色素颗粒（NMG）的结构内。这些神经元在帕金森病和路易体痴呆等神经退行性疾病中会丢失。尽管已知脂质、蛋白质和环境毒素会在NMG中蓄积，但NMG的功能、起源以及神经黑色素的合成尚未最终阐明。因此，我们通过激光显微切割从对照患者中分离了NMG及周围的黑质组织，并利用串联质谱分析了蛋白质组谱。借助改进的工作流程，我们得以：1）强化了既往反复报道的NMG与溶酶体之间的联系；2）检测到酪氨酸羟化酶在NMG中高度丰富，这可能与神经黑色素合成有关；3）提示应激颗粒（SG）与NMG之间存在尚未被描述的联系。基于这些发现，我们谨慎地推测，SG可能是NMG的起源，或在NMG附近形成，这或许归因于神经黑色素结合金属所导致的氧化应激。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。