多系统萎缩小脑组织转录谱补充文件2:帕金森型与小脑型亚型差异

该数据集为多系统萎缩小脑组织转录谱研究的补充文件2,包含8张表格,分别列出队列1和队列2中MSA、MSA-P、MSA-C的差异表达基因,p值组合的完整显著结果,以及按临床亚型分层的SND和OPCA患者差异基因和功能网络富集分析结果

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2023-06-04 更新
浏览 2
基因组分类Multiple system atrophyRNA sequencingOligodendrocytesNeurodegeneration
Additional file 2 of Transcriptional profiling of multiple system atrophy cerebellar tissue highlights differences between the parkinsonian and cerebellar sub-types of the disease

基本信息

模态
基因组
大小
0.000739971 GB
任务类型
分类
许可
CC BY + CC0
创建/更新时间
2023-06-04
版本
v1

资源简介

多系统萎缩小脑组织转录谱补充文件2:帕金森型与小脑型亚型差异

Additional file 2 of Transcriptional profiling of multiple system atrophy cerebellar tissue highlights differences between the parkinsonian and cerebellar sub-types of the disease

该数据集为多系统萎缩小脑组织转录谱研究的补充文件2,包含8张表格,分别列出队列1和队列2中MSA、MSA-P、MSA-C的差异表达基因,p值组合的完整显著结果,以及按临床亚型分层的SND和OPCA患者差异基因和功能网络富集分析结果。数据可用于比较帕金森型与小脑型多系统萎缩的转录差异,支持神经退行性疾病分子机制研究(来源 figshare,CC BY + CC0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Genetic Variants of the α-Synuclein Gene SNCA Are Associated with Multiple System Atrophy》发表于 PLoS ONE(2009),DOI:10.1371/journal.pone.0007114。项目资助方:Austrian Science Fund National Institute of Neurological Disorders and Stroke National Institute on Aging (US) National Institute on Alcohol Abuse and Alcoholism。源站首次发布:2020-06-04。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):补充文件2 表S1. 在MSA的队列1和队列2中检测到的差异表达基因。表S2. 在MSA-P的队列1和队列2中检测到的差异表达基因。表S3. 队列1和2中MSA-C的差异表达基因,按p值排序。表S4:MSA(MSA-P + MSA-C)p值组合的完整显著结果。表S5:MSA-P的p值组合的完整显著结果。表S6:两个MSA-C队列的差异表达结果经p值组合后的完整显著结果。表S7. 来自队列2的SND(A)和OPCA(B)MSA患者的差异表达基因。按相应临床亚型分层后仍显著的基因以灰色报告(MSA-P/SND或MSA-C/OPCA)。表S8. 所检测DEGs的功能网络富集分析的完整结果

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 739.97 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.12422432.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Genetics。主题标签:Multiple system atrophy、RNA sequencing、Oligodendrocytes、Neurodegeneration。本站分类:神经系统疾病/帕金森病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genetics。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_Transcriptional_profiling_of_multiple_system_atrophy_cerebellar_tissue_highlights_differences_between_the_parkinsonian_and_cerebellar_sub-types_of_the_disease/12422432

使用许可:CC BY + CC0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Piras, Ignazio S.; Bleul, Christiane; Schrauwen, Isabelle; Talboom, Joshua; Llaci, Lorida; De Both, Matthew D.; et al. (2020). Additional file 2 of Transcriptional profiling of multiple system atrophy cerebellar tissue highlights differences between the parkinsonian and cerebellar sub-types of the d…

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "40478_2020_950_MOESM2_ESM.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/22892834"

文件清单

  • 40478_2020_950_MOESM2_ESM.xlsx(739.97 KB)

文件总体积 739.97 KB(源站 API 实测)。

数据说明

补充文件2 表S1. 在MSA队列1和队列2中检测到的差异表达基因。表S2. 在MSA-P队列1和队列2中检测到的差异表达基因。表S3. 按p值排序的队列1和2中MSA-C检测到的差异表达基因。表S4:MSA(MSA-P + MSA-C)p值组合的完整显著结果。表S5:MSA-P p值组合的完整显著结果。表S6:两个MSA-C队列差异表达结果p值组合后的完整显著结果。表S7. 队列2中SND(A)和OPCA(B)MSA患者的差异表达基因。按相应临床亚型(MSA-P/SND或MSA-C/OPCA)分层后仍显著的基因以灰色标示。表S8. MSA-C中检测到的DEGs功能网络富集分析的完整结果。表S9. 队列1中MSA-C与MSA-P比较检测到的差异表达基因。队列2中未检测到差异表达基因。

表S10:两个MSA-C队列的差异表达结果(MSA-C vs MSA-P)经p值合并后的前10位结果。经多重检验校正后,无基因显示显著性。表S11. 来自队列2的OPCA vs SND患者比较中的差异表达基因。表S12. 对OPCA vs SND比较中获得的156个DEGs进行GO分析的结果。表S13. AD基因(AMP-AD数据集)在MSA-C差异表达基因中的富集。(A) 使用不同DEGs截断值筛选AD基因所进行的富集分析。(B) 使用非DEGs(adj p ≥ 0.950)所进行的富集分析。表S14. MSA-C DEGs、AD颞叶皮层与AD海马旁回(数据来自AMP-AD)之间的重叠。基因按MSA-C中的adj p排序。表S15. 在少突胶质细胞中检测到的差异表达基因(adj p < 0.05)。表S16. 细胞特异性GO分析的结果。表S17. 与MSA-C显著相关的颜色编码模块中所包含基因的详细信息。基因按模块成员资格p值排序。每个模块的枢纽基因以粗体标示。表S18. Compl

许可

CC BY + CC0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.12422432.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_Transcriptional_profiling_of_multiple_system_atrophy_cerebellar_tissue_highlights_differences_between_the_parkinsonian_and_cerebellar_sub-types_of_the_disease/12422432)。

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