CrossMoDA前庭神经鞘瘤分割

Vestibular Schwannoma Segmentation Challenge 面向神经纤维瘤病及相关临床研究,提供公开可访问的图像数据、标注或队列信息,适合用于图像分割、疾病表型分层、结构测量、风险预测和医学AI模型基准测试。

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Grand Challenge
2024-01-01 更新
浏览 35
图像图像分割vestibular schwannomacochleabrainMRIceT1hrT2domain adaptationimage segmentationunsupervised
Vestibular Schwannoma Segmentation Challenge

基本信息

模态
图像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2024-01-01

资源简介

CrossMoDA前庭神经鞘瘤分割

【一句话概览】

该挑战提出首个无监督跨模态域适应医学影像基准,实现从对比增强T1到高分辨率T2的迁移。目标是分割前庭神经鞘瘤随访与治疗规划涉及的两个关键脑结构:肿瘤与耳蜗。对比增强T1 MRI常用于前庭神经鞘瘤分割,而近期工作表明高分辨率T2可成为可靠、更安全且成本更低的替代方案。因此,该挑战旨在高分辨率T2扫描上自动完成前庭神经鞘瘤与耳蜗分割。训练源集与目标集分别为非配对的标注对比增强T1与未标注高分辨率T2扫描(来源 crossmoda.grand-challenge.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Cross-Modality Domain Adaptation Image Segmentation - 2021》。

【数据内容】

源站原始描述:This challenge proposes the first medical imaging benchmark of unsupervised cross-modality Domain Adaptation approaches (from contrast-enhanced T1 to high-resolution T2). The goal of the challenge is to segment two key brain structures involved in the follow-up and treatment planning of vestibular schwannoma (VS): the tumour and the cochlea. While contrast-enhanced T1 (ceT1) Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans are commonly used for VS segmentation, recent work has demonstrated that high-resol…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):该挑战提出了首个无监督跨模态域适应方法(从对比增强T1到高分辨率T2)的医学影像基准。挑战的目标是分割与前庭神经鞘瘤(VS)随访和治疗计划相关的两个关键脑结构:肿瘤和耳蜗。虽然对比增强T1(ceT1)磁共振成像(MRI)扫描常用于VS分割,但近期研究表明,高分辨率T2(hrT2)成像可能是ceT1的一种可靠、更安全且成本更低的替代方案。因此,我们提出了一项无监督跨模态挑战(从ceT1到hrT2),旨在自动在hrT2扫描上执行VS和耳蜗分割。训练源集和目标集分别为未配对的已标注ceT1扫描和未标注的hrT2扫描。

【主题与分类】

主题标签:vestibular schwannoma、cochlea、brain、MRI、ceT1、hrT2、domain adaptation、image segmentation、unsupervised。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://crossmoda.grand-challenge.org/

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源站:https://crossmoda.grand-challenge.org/

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Vestibular Schwannoma Segmentation Challenge 是与神经纤维瘤病相关的公开数据集,包含图像数据,可用于图像分割、表型识别、疾病评估或算法验证。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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