痴呆患者全血代谢组学揭示疾病相关代谢物类别

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS2109

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

痴呆是由损害神经元的因素引起的。我们采用非靶向液相色谱-质谱联用技术（LC-MS）对痴呆患者全血中的小分子标志物进行了定量分析。与健康老年人相比，痴呆患者中有33种代谢物存在显著差异，这些代谢物被分为5组（A-E）。A组中有7种代谢物存在于血浆中，包括喹啉酸、犬尿氨酸和吲哚硫酸盐，其水平升高。它们可能在中枢神经系统（CNS）中充当神经毒素。其余26种化合物（B-E组）则减少，可能导致痴呆中大脑支持或保护的丧失。B组中的6种代谢物通常在健康受试者的红细胞（RBCs）中富集，均含有三甲基铵基团。这些代谢物包括麦角硫因及结构相关的化合物，作为痴呆标志物的研究甚少，这验证了对红细胞代谢物检查的必要性。麦角硫因是一种强效抗氧化剂，在多种认知相关障碍中显著减少，如轻度认知障碍和衰弱。

C组化合物还包括一些氧化还原剂，通常在红细胞中含量丰富（NADP+、谷胱甘肽、ATP、泛酸、S-腺苷甲硫氨酸和葡萄糖酸）。它们在痴呆患者中水平下降，也可能导致脑功能抑制。D组（12种）包含血浆化合物，如氨基酸、甘油磷酸胆碱、十二酰肉碱、2-羟基丁酸，这些通常保护大脑，但在痴呆中它们的减少可能降低这种保护作用。七种D组化合物先前已被确定为痴呆标志物。B-E组化合物可能通过直接或间接作用对维持中枢神经系统至关重要。红细胞代谢物如何在中枢神经系统中发挥作用，以及为何在痴呆中显著减少，仍有待确定。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。