TDP-43敲低与非沉默对照BV2小胶质细胞转录组数据集

TDP-43功能异常与ALS、FTD等神经退行性疾病相关,研究聚焦小胶质细胞在神经炎症和疾病进展中的作用。数据可用于差异表达与通路分析,探索TDP-43缺失对小胶质细胞转录程序的影响(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许

figsharefigshare
datacite
浏览 17
基因组分类Neurology and neuromuscular diseases
Transcriptomics Dataset of BV2 Microglia cells Following TDP-43 Knockdown and Non-Silencing Control

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

TDP-43敲低与非沉默对照BV2小胶质细胞转录组数据集

Transcriptomics Dataset of BV2 Microglia cells Following TDP-43 Knockdown and Non-Silencing Control

该数据集为Bulk RNA-seq转录组数据,比较TDP-43 RNAi敲低与non-silencing control siRNA处理的BV2小胶质细胞,物种为Mus musculus。TDP-43功能异常与ALS、FTD等神经退行性疾病相关,研究聚焦小胶质细胞在神经炎症和疾病进展中的作用。数据可用于差异表达与通路分析,探索TDP-43缺失对小胶质细胞转录程序的影响(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2025。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在本研究中,我们探究RNA结合蛋白TDP-43的敲低如何改变BV2小胶质细胞的转录程序。TDP-43功能异常是肌萎缩侧索硬化(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)等神经退行性疾病的标志,尽管大多数研究集中在神经元上,但新出现的证据表明小胶质细胞在调节神经炎症和疾病进展中起关键作用。我们采用RNA干扰在BV2细胞中特异性耗竭TDP-43(TDP-43 RNAi),并与经非沉默对照siRNA处理的细胞进行比较。原始reads和方案细节可在ArrayExpress中获取,登录号:E-MTAB-15184 研究类型:编码RNA的Bulk RNA-seq 生物体:Mus musculus 注:该数据集是figshare数据集

【主题与分类】

主题标签:Neurology and neuromuscular diseases。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Transcriptomics_Dataset_of_BV2_Microglia_cells_Following_TDP-43_Knockdown_and_Non-Silencing_Control/29256263/1

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.29256263.v1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们探讨了RNA结合蛋白TDP-43的敲低如何改变BV2小胶质细胞的转录程序。TDP-43功能异常是肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)等神经退行性疾病的标志性特征,尽管大多数研究集中于神经元,但新兴证据表明小胶质细胞在调节神经炎症和疾病进展中发挥关键作用。我们采用RNA干扰技术在BV2细胞中特异性敲低TDP-43(TDP-43 RNAi),并将其与使用非沉默对照siRNA处理的细胞进行比较。原始reads和实验方案详情可在ArrayExpress中查阅,登录号:E-MTAB-15184 研究类型:编码RNA的bulk RNA-seq 生物体:Mus musculus 注:该数据集为figshare数据集(https://doi.org/10.6084/m9.figshare.25898785.v1)的配套数据。原始数据引用:TBA

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。