神经精神障碍高阶共享遗传易感因子H3的SNP权重与东亚评估数据

该数据集包含基于八种神经精神障碍欧洲血统GWAS估计的高阶共享遗传易感因子H3的961,268个SNP权重,采用PRS-CS(phi=0.01)和1000 Genomes欧洲连锁不平衡参考估计

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基因组预测Anthropological geneticsNeurology and neuromuscular diseases
Neuropsychiatric Disorder

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-11-03
版本
5

资源简介

神经精神障碍高阶共享遗传易感因子H3的SNP权重与东亚评估数据

Neuropsychiatric Disorder

该数据集包含基于八种神经精神障碍欧洲血统GWAS估计的高阶共享遗传易感因子H3的961,268个SNP权重,采用PRS-CS(phi=0.01)和1000 Genomes欧洲连锁不平衡参考估计。压缩包内含发现输入、后验权重、东亚精神分裂症、重性抑郁障碍和双相障碍的协调汇总统计子集、匹配评分文件、分块贡献以及主要和敏感性结果。评估使用自定义固定评分汇总统计近似和东亚参考连锁不平衡,三个结局在平衡病例对照尺度上的近似平方相关分别为0.03233、0.00721和0.01430。该数据可用于跨人群多基因风险评分构建与评估(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):ArchiveNPD_H3_PRS_Weights_and_EAS_Evaluation.zipDescription该数据集包含961,268个SNP权重,用于高阶共享遗传易感因子H3,该因子源自八种神经精神障碍的欧洲血统GWAS。权重使用PRS-CS以phi=0.01和1000 Genomes欧洲连锁不平衡参考进行估计。压缩包包括发现输入、后验权重、协调后的东亚精神分裂症、重性抑郁障碍和双相障碍汇总统计子集、匹配评分文件、分块贡献以及主要和敏感性结果。评估使用自定义固定评分汇总统计近似和东亚参考连锁不平衡。三个结局在平衡病例对照尺度上的近似平方相关分别为0.03233、0.00721和0.01430。这些量化了基于汇总的关联

【主题与分类】

主题标签:Anthropological genetics、Neurology and neuromuscular diseases。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Neuropsychiatric_Disorder/30019267/5

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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数据说明

ArchiveNPD_H3_PRS_Weights_and_EAS_Evaluation.zip描述本数据集包含961,268个SNP权重,用于高阶共享遗传易感因子H3,该因子源自八种神经精神疾病的欧洲血统GWAS。权重使用PRS-CS估计,参数phi=0.01,并采用1000 Genomes欧洲连锁不平衡参考。压缩包包括发现输入、后验权重、协调后的东亚精神分裂症、重性抑郁障碍和双相障碍汇总统计子集、匹配得分文件、各区块贡献以及主要和敏感性结果。评估采用自定义固定得分汇总统计近似方法,并使用东亚参考连锁不平衡。在平衡病例对照尺度上的近似平方相关系数分别为0.03233、0.00721和0.01430,对应三个结局。这些量化的是基于汇总统计的关联;未评估个体水平的预测性能。得分在评估前已固定,目标血统效应被排除在训练和调参之外。

包含GRCh37/hg19坐标、效应等位基因、有效样本量约定、可复现脚本、来源引用、字段定义和SHA-256校验和。ArchivegsMap_NPD_Spatial_Data.zip描述本数据集提供了E16.5_E1S1 MOSTA小鼠胚胎参考中共享NPD遗传信号的gsMap空间关联结果和候选基因表达数据。它包含25个组织注释中的121,767个空间点,并包括点水平关联统计、区域Cauchy组合结果、候选基因特异性评分、标准化表达谱、表达摘要、基因诊断以及分析中使用的确切GWAS输入。脑和脊髓显示最小的区域Cauchy P值。运行元数据将这些空间结果所使用的GWAS输入与单独整理的QC GWAS数据集区分开来。数据字典、描述性摘要脚本和多

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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