LGI1降解组基础图谱

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5522/04/34082109

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数据说明

该Figshare存储库收录了LGI1降解组基础图谱（第1版），这是对人类富亮氨酸胶质瘤失活蛋白1（LGI1）经蛋白水解切割所产生的理论肽段景观的全面计算机模拟重建，该蛋白由LGI1基因编码（UniProt：O95970）。该图谱包含野生型LGI1序列以及三个疾病相关变异体——C48F、I82T和S524P，这些变异与发育性和癫痫性脑病121型（DEE121）相关。该图谱为从事蛋白质组学、降解组学、质谱分析、神经生物学、癫痫研究、遗传疾病、生物标志物发现和精准医学的研究人员提供了一个开放获取的计算参考。通过系统性地绘制LGI1蛋白水解加工和周转所产生的潜在肽段片段，该数据集提供了一个以降解组为中心的框架，用于研究序列变异如何影响这一神经学重要蛋白的理论肽段景观。生物学背景：LGI1是一种分泌型神经元蛋白，在突触组织、神经元信号传导和神经元兴奋性调节中发挥重要作用。

LGI1与参与突触功能的细胞表面蛋白及细胞外组分相互作用，是神经元之间正常通讯的重要贡献者。LGI1功能破坏与神经系统疾病相关，尤其是癫痫和神经元发育障碍。LGI1的致病性变异可改变该蛋白的结构、加工、稳定性、分泌或生物活性，可能影响神经元信号传导和网络兴奋性。本图谱收录的C48F、I82T和S524P变异与发育性及癫痫性脑病121型（DEE121）相关，这是一种常染色体隐性遗传病，以早发性癫痫和进行性神经发育损害为特征。DEE121属于一组异质性发育性

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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