IR-MALDESI MSI与平行反应监测MSI解析球形细胞脑白质营养不良小鼠脑模型的空间脂质

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A780662c715ebe125855b7ac08d81798ee6fb6cdee79f1f5954539496b142ff3a

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

球形细胞脑白质营养不良（GLD）是一种遗传性神经退行性疾病，由半乳糖神经酰胺β-半乳糖苷酶（GALC）突变引起，导致细胞毒性鞘脂——神经鞘氨醇的蓄积。由于神经鞘氨醇是GLD特异性的生物标志物，识别神经系统受累最严重的区域有助于更好地理解该疾病的机制。本研究采用红外矩阵辅助激光解吸电喷雾电离（IR-MALDESI）质谱成像（MSI）和平行反应监测技术，阐明了GALC缺陷小鼠脑矢状切片中神经鞘氨醇分析物的空间分布，并确认了该离子的身份。神经鞘氨醇在脑中负责受GLD损害的身体功能的特定解剖区域（小脑和脑干）中含量增加。

若干电喷雾溶剂添加剂（掺杂剂）增强了对多种分析物类型的检测，但在……方面收效甚微，# 数据来源：通过IR-MALDESI MSI和平行反应监测MSI对球形细胞脑白质营养不良小鼠脑模型中的空间分辨脂质 数据集DOI：10.5061/dryad.fttdz096q ## 数据及文件结构说明 本手稿所收集的数据。所有文件均转换为.mzML格式，随后转换为.imzML格式，以便在MSiReader软件中进行分析。否则，.raw数据文件可在Freestyle中打开。这些数据也可在OpenChrom中打开，但相应研究未使用该软件，作者亦未使用这些数据对该软件进行测试。 ### 利益披露 David C. Muddiman是MSI Software Solutions， LLC的部分所有者，该公司生产用于这些数据分析的MSiReader软件。 ### 文件与变量 #### 文件：NH4F_Doped_with_Ice_Matrix.raw 描述： 以25 μm分辨率采集的Twitcher小鼠脑图像，通过红外矩阵辅助激光解吸电

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。