痣、原发性黑色素瘤及黑色素瘤转移切片的MALDI-IMS质谱成像数据集(imzML格式)

该数据集包含53例痣、原发性黑色素瘤及黑色素瘤转移病理切片的MALDI-IMS质谱成像数据(imzML格式),空间分辨率为25微米/像素,同时提供伊红-苏木精染色、免疫组化标记与质谱分割图像的对比文件,主要应用于黑色素瘤的分子病理学分析、空间代谢组学研究及生物标志物发现。

Department of Physical Chemistry, Faculty of Science and Technology, University of the Basque Country (UPV/EHU), Barrio Sarriena, s/n, 48940 Leioa, SpainDepartment of Physical Chemistry, Faculty of Science and Technology, University of the Basque Country (UPV/EHU), Barrio Sarriena, s/n, 48940 Leioa, Spain
Zenodo
2023-10-25 更新
浏览 10
mass spectrometry imaginglipidsmelanomanevusmetastatic melanoma
MALDI-IMS Dataset of Nevus, Primary Melanoma and Melanoma Metastasis Sections in imzML Format

基本信息

大小
24.341445179 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2023-10-25

资源简介

痣、原发性黑色素瘤及黑色素瘤转移切片的MALDI-IMS质谱成像数据集(imzML格式)

【数据集背景】

本数据集源站标题为《MALDI-IMS files of 53 experiments over sections of nevus, primary melanoma and melanoma metastasis in imzml format》。项目资助方:Investigación Multidisciplinar del Melanoma Maligno. Identificación de nuevos biomarcadores de utilidad en el pronóstico y tratamiento del melanoma。源站首次发布:2023-10-24。

【数据内容】

源站原始描述:MALDI-IMS files of 53 experiments over sections of nevus, primary melanoma and melanoma metastasis in imzml format. The experiments were recorded in negative-ion mode with a MALDI LTQ-orbitrap XL (ThermoFisher) at 25 um/pixel of spatial resolution. We also uploaded three .ppt with a comparison between the eosin-hematoxilin images, the IHC (MelanA and HMB45) and the segmentation images

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 24.34 GB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.10036138。

【主题与分类】

主题标签:mass spectrometry imaging、lipids、melanoma、nevus、metastatic melanoma。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/10036138

使用许可:cc-by-4.0。

规范引用:International Journal of Cancer

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-10-25,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10036137

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数据说明

该数据集包含53个实验的MALDI-IMS(基质辅助激光解吸电离成像质谱)文件,覆盖痣、原发性黑色素瘤和黑色素瘤转移的病理切片样本,数据以imzML格式存储。实验使用MALDI LTQ-orbitrap XL质谱仪在负离子模式下采集,空间分辨率为25微米/像素。此外,数据集还提供了三个PPT文件,展示了伊红-苏木精染色图像、免疫组化(MelanA和HMB45)标记结果与质谱成像分割图像的对比分析。该数据集主要用于黑色素瘤的分子病理学研究、生物标志物发现及空间代谢组学分析。

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