创伤后人类周围神经空间转录组数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.011wo

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

创伤性周围神经损伤常导致异常再生和创伤性神经瘤，进而引起持续性神经病理性疼痛。然而，人类损伤周围神经的空间分辨分子特征仍未被充分表征。在此，我们构建了人类周围神经的空间转录组数据集，包括一份相对正常的神经样本和一份伤后两周采集的损伤神经样本。空间转录组文库使用CelAtlas Spatial平台构建，并使用GeneMind SURFSeq 5000平台测序。该数据集包括原始测序文件、空间表达矩阵、样本元数据和处理后的分析文件。该资源提供了人类损伤周围神经的空间分子图谱，或可支持对细胞组织、免疫反应、细胞外基质重塑以及与周围神经损伤、创伤性神经瘤形成和神经病理性疼痛相关的分子改变的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。