12例原发/复发IDH突变星形细胞瘤样本的NanoString GeoMx DSP数据集
该数据集包含6名IDH突变星形细胞瘤患者的12对配对肿瘤样本的空间转录组数据，采用NanoString GeoMx数字空间分析技术测量约1800个基因在72个感兴趣区域的RNA表达水平，并提供了相应的组织图像。数据模态包括基因表达矩阵和病理图像，主要用于研究IDH突变星形细胞瘤的分子异质性、复发机制及空间转录组特征，支持神经胶质瘤分子病理学和空间转录组学领域的研究。
基本信息
资源简介
12例原发/复发IDH突变星形细胞瘤样本的NanoString GeoMx DSP数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《NanoString GeoMx DSP dataset from 12 primary/recurrent IDH-mutant astrocytoma samples》。源站首次发布：2024。
【数据内容】
源站原始描述：NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler data from 12 paired tumor resections of 6 IDH-mutant astrocytoma patients. All samples had an IDH-R132H mutation. all first resections were WHO 2016 grade II or III and second resections were WHO 2016 grade IV. The NanoString Cancer Transcriptome Atlas panel was used to measure RNA expression levels of ~1800 genes in 72 regions of interest. ROIs folder contains all images of the regions of interest used in this study, separated by tumor pairs. For inform…
文件 metadata.txt 为文本内容，开头为："Sample" "ROI" "Type" "AOISurfaceArea" "AOINucleiCount" "RawReads" "DeduplicatedReads" "TrimmedReads" "StitchedReads" "AlignedReads" "SequencingSaturation" "te…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个，合计 1.09 GB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.13911761。
【主题与分类】
主题标签：IDH-mutant astrocytoma、Spatial transcriptomics。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/13911761
使用许可：cc-by-4.0。
规范引用：iScience
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-10-10，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.7348325
（注册/登录后按页面指引下载）
数据说明
该数据集包含来自6名IDH突变星形细胞瘤患者的12对配对肿瘤切除样本的NanoString GeoMx数字空间分析仪数据。所有样本均携带IDH-R132H突变，首次切除样本为WHO 2016分级II级或III级，二次切除样本为WHO 2016分级IV级。通过NanoString癌症转录组图谱面板，测量了72个感兴趣区域中约1800个基因的RNA表达水平。数据集还提供了研究中使用的所有感兴趣区域的图像，按肿瘤对分组。该数据集可用于研究IDH突变星形细胞瘤的分子异质性、复发机制以及空间转录组学特征，主要应用于神经胶质瘤分子病理学和空间转录组学领域。
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