使用10X Genomics Visium平台与定制KSHV探针的卡波西肉瘤病灶空间转录组学数据集
该数据集包含通过10X Genomics Visium平台采集的7个卡波西肉瘤皮肤肿瘤样本的空间转录组学数据，特别采用针对5个KSHV病毒基因的定制探针，实现了人类基因与病毒基因表达的空间同步检测，数据模态包括空间基因表达矩阵和探针信息，主要用于研究卡波西肉瘤肿瘤微环境中宿主与病毒的相互作用机制、肿瘤异质性特征以及病毒基因在组织中的空间分布模式。
基本信息
资源简介
使用10X Genomics Visium平台与定制KSHV探针的卡波西肉瘤病灶空间转录组学数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Spatial transcriptomics of Kaposi sarcoma lesions using 10X Genomics Visium platform with custom KSHV probes》。源站首次发布：2025-12-09。
【数据内容】
源站原始描述：We performed spatial transcriptomics with seven KS skin tumors. We included custom probes for five KSHV genes that allowed us to measure human and KSHV expression patterns at the same time. Please see the README file for more information about the files. The five KSHV gene names can be found in the features list in the file "4samples_aggr_cloupe.cloupe"
【数据结构与技术规格】
文件数 9 个，合计 4.11 GB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.30840407.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Virology。主题标签：Spatial transcriptomics、Visium、Kaposi sarcoma、KSHV。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Virology。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Spatial_transcriptomics_of_Kaposi_sarcoma_lesions_using_10X_Genomics_Visium_platform_with_custom_KSHV_probes/30840407
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Ziegelbauer, Joseph (2025). Spatial transcriptomics of Kaposi sarcoma lesions using 10X Genomics Visium platform with custom KSHV probes. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集包含对7个卡波西肉瘤皮肤肿瘤样本进行空间转录组学分析的结果。数据采用10X Genomics Visium平台采集，并特别设计了针对5个KSHV（卡波西肉瘤相关疱疹病毒）基因的定制探针，实现了在同一实验中同步检测人类基因表达和病毒基因表达的空间分布模式。数据集包含空间基因表达矩阵、探针信息及可视化文件，主要应用于研究卡波西肉瘤肿瘤微环境中宿主-病毒相互作用、肿瘤异质性以及病毒基因表达的空间定位等方向。
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