使用10X Genomics Visium平台与定制KSHV探针的卡波西肉瘤病灶空间转录组学数据集
该数据集包含通过10X Genomics Visium平台采集的7个卡波西肉瘤皮肤肿瘤样本的空间转录组学数据，特别采用针对5个KSHV病毒基因的定制探针，实现了人类基因与病毒基因表达的空间同步检测，数据模态包括空间基因表达矩阵和探针信息，主要用于研究卡波西肉瘤肿瘤微环境中宿主与病毒的相互作用机制、肿瘤异质性特征以及病毒基因在组织中的空间分布模式。
创建时间2025-12-09
更新时间2025-12-09
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Spatial_transcriptomics_of_Kaposi_sarcoma_lesions_using_10X_Genomics_Visium_platform_with_custom_KSHV_probes/30840407
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资源简介
该数据集包含对7个卡波西肉瘤皮肤肿瘤样本进行空间转录组学分析的结果。数据采用10X Genomics Visium平台采集，并特别设计了针对5个KSHV（卡波西肉瘤相关疱疹病毒）基因的定制探针，实现了在同一实验中同步检测人类基因表达和病毒基因表达的空间分布模式。数据集包含空间基因表达矩阵、探针信息及可视化文件，主要应用于研究卡波西肉瘤肿瘤微环境中宿主-病毒相互作用、肿瘤异质性以及病毒基因表达的空间定位等方向。
提供机构：Ziegelbauer, Joseph
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