卡波西肉瘤中全球CpG DNA甲基化足迹数据集
该数据集包含通过甲基化芯片技术获取的正常皮肤与不同阶段卡波西肉瘤活检组织的全基因组CpG位点甲基化数据，属于表观遗传学模态，主要用于研究卡波西肉瘤发展过程中DNA甲基化模式的动态变化，揭示病毒相关肿瘤的表观遗传调控机制，为理解KSHV感染如何通过甲基化修饰驱动肿瘤发生提供关键分子层面的证据。
基本信息
资源简介
卡波西肉瘤中全球CpG DNA甲基化足迹数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《DataSheet_1_Global CpG DNA Methylation Footprint in Kaposi’s Sarcoma.pdf》。配套论文《Identification of Herpesvirus-Like DNA Sequences in AIDS-Sssociated Kaposi''s Sarcoma》发表于 Science（1994），DOI：10.1126/science.7997879。源站首次发布：2021-07-09。
【数据内容】
源站原始描述：Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus (KSHV), also familiar as human herpesvirus 8 (HHV-8), is one of the well-known human cancer-causing viruses. KSHV was originally discovered by its association with Kaposi’s sarcoma (KS), a common AIDS-related neoplasia. Additionally, KSHV is associated with two B-lymphocyte disorders; primary effusion lymphoma (PEL) and Multicentric Castlemans Disease (MCD). DNA methylation is an epigenetic modification that is essential for a properly functioning human ge…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 265.31 KB。DataSheet_1_Global CpG DNA Methylation Footprint in Kaposi’s Sarcoma.pdf：application/pdf，265.31 KB。数据集 DOI：10.3389/fcimb.2021.666143.s001。
【主题与分类】
源站学科分类：Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。主题标签：Kaposi’s sarcoma、CpG methylation、KS、KSHV、gene expression、promoter、enhancer。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Global_CpG_DNA_Methylation_Footprint_in_Kaposi_s_Sarcoma_pdf/14939256
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Journo, Guy; Ahuja, Anuj; Dias-Polak, David; Eran, Yonatan; Bergman, Reuven; Shamay, Meir (2021). DataSheet_1_Global CpG DNA Methylation Footprint in Kaposi’s Sarcoma.pdf. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于卡波西肉瘤（Kaposi’s sarcoma, KS）中全基因组CpG位点的DNA甲基化状态。数据集通过MethylationEPIC BeadChip芯片技术，比较了正常皮肤组织与不同发展阶段（斑块期与结节期）卡波西肉瘤活检组织之间的全基因组甲基化差异。数据揭示了KS发展过程中发生的显著全局甲基化改变，包括许多与异常皮肤形态相关基因的启动子和增强子区域发生高甲基化，以及在疾病进展到结节期时低甲基化CpG位点的大量增加。该数据集为研究卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）感染引起的表观遗传学改变与肿瘤发生之间的关系提供了重要资源，主要应用于肿瘤表观遗传学、病毒致癌机制及KS病理生物学研究。
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