卡波西肉瘤全球CpG DNA甲基化足迹数据集
该数据集包含卡波西肉瘤(KS)的DNA甲基化数据,通过MethylationEPIC BeadChip技术获取正常皮肤与KS活检组织的全局CpG甲基化信息,数据模态为表观遗传学中的甲基化谱。其主要用途是研究KS发展过程中启动子和增强子区域的甲基化变化,特别是超甲基化与低甲基化模式,以揭示卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)感染导致的表观遗传修饰与肿瘤发生之间的关联,适用于表观遗传学和肿瘤生物学领域的研究。

基本信息
资源简介
卡波西肉瘤全球CpG DNA甲基化足迹数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《DataSheet_1_Global CpG DNA Methylation Footprint in Kaposi’s Sarcoma.pdf》。配套论文《Identification of Herpesvirus-Like DNA Sequences in AIDS-Sssociated Kaposi''s Sarcoma》发表于 Science(1994),DOI:10.1126/science.7997879。源站首次发布:2021-07-09。
【数据内容】
源站原始描述:Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus (KSHV), also familiar as human herpesvirus 8 (HHV-8), is one of the well-known human cancer-causing viruses. KSHV was originally discovered by its association with Kaposi’s sarcoma (KS), a common AIDS-related neoplasia. Additionally, KSHV is associated with two B-lymphocyte disorders; primary effusion lymphoma (PEL) and Multicentric Castlemans Disease (MCD). DNA methylation is an epigenetic modification that is essential for a properly functioning human ge…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 265.31 KB。DataSheet_1_Global CpG DNA Methylation Footprint in Kaposi’s Sarcoma.pdf:application/pdf,265.31 KB。数据集 DOI:10.3389/fcimb.2021.666143.s001。
【主题与分类】
源站学科分类:Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。主题标签:Kaposi’s sarcoma、CpG methylation、KS、KSHV、gene expression、promoter、enhancer。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。
【获取与许可】
源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Global_CpG_DNA_Methylation_Footprint_in_Kaposi_s_Sarcoma_pdf/14939256
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Journo, Guy; Ahuja, Anuj; Dias-Polak, David; Eran, Yonatan; Bergman, Reuven; Shamay, Meir (2021). DataSheet_1_Global CpG DNA Methylation Footprint in Kaposi’s Sarcoma.pdf. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于卡波西肉瘤(KS)相关的DNA甲基化特征,通过MethylationEPIC BeadChip技术比较正常皮肤与KS活检组织的全局甲基化状态,揭示了KS中发生的显著甲基化改变。数据包含KS早期(斑块)和进展期(结节)阶段的CpG位点甲基化信息,特别关注启动子和增强子区域的超甲基化与低甲基化模式,这些变化与异常皮肤形态和肿瘤发生相关。数据来源为公开的实验研究,主要应用于表观遗传学、肿瘤生物学和病毒相关癌症(如卡波西肉瘤相关疱疹病毒KSHV感染)的研究方向。
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