SMN缺陷扰动脊髓性肌萎缩症中单胺神经递质代谢
该数据集来自omicsdi.org,主题为代谢组学,聚焦SMN缺陷对脊髓性肌萎缩症(SMA)中单胺神经递质代谢的影响。源站描述显示,研究利用非靶向NMR代谢组学在SMA小鼠中识别出与能量稳态通路和氨基酸代谢相关的脑与肝脏异常,并通过HPLC发现SMN缺陷诱导症状明显SMA小鼠脑内去甲肾上腺素水平下降

基本信息
资源简介
SMN缺陷扰动脊髓性肌萎缩症中单胺神经递质代谢
该数据集来自omicsdi.org,主题为代谢组学,聚焦SMN缺陷对脊髓性肌萎缩症(SMA)中单胺神经递质代谢的影响。源站描述显示,研究利用非靶向NMR代谢组学在SMA小鼠中识别出与能量稳态通路和氨基酸代谢相关的脑与肝脏异常,并通过HPLC发现SMN缺陷诱导症状明显SMA小鼠脑内去甲肾上腺素水平下降,影响单胺代谢关键基因的mRNA和蛋白表达。数据可用于研究SMA的代谢缺陷及神经递质代谢机制(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):除运动神经元变性外,生存运动神经元1(SMN1)基因的纯合突变还会导致脊髓性肌萎缩症(SMA)患者出现多器官和代谢缺陷。然而,这些改变的确切生化特征以及大脑和外周器官中的发病年龄仍不清楚。利用基于NMR的非靶向代谢组学在SMA小鼠中,我们识别出与能量稳态通路和氨基酸代谢相关的脑和肝脏异常,这些异常在出生后第3天(P3)的肝脏中就已出现。通过HPLC,我们发现SMN缺陷在P11症状明显的SMA小鼠中诱导脑内去甲肾上腺素水平下降,影响调节单胺代谢的关键基因的mRNA和蛋白表达,包括芳香族L-氨基酸脱羧酶(AADC)、多巴胺β-羟化酶(DβH)和单胺氧化酶A(MAO-A)。为支持这一转
【主题与分类】
主题标签:Metabolomics。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS8784
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源站:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS8784
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
除运动神经元变性外,存活运动神经元1(SMN1)基因的纯合突变还会导致脊髓性肌萎缩症(SMA)患者出现多器官及代谢缺陷。然而,这些改变的确切生化特征以及大脑和外周器官中发病年龄仍不清楚。利用基于非靶向NMR的代谢组学方法对SMA小鼠进行研究,我们发现了与能量稳态通路和氨基酸代谢相关的脑部和肝脏异常,这些异常在出生后第3天(P3)的肝脏中即已出现。通过HPLC,我们发现SMN缺陷导致P11时症状明显的SMA小鼠脑内去甲肾上腺素水平下降,影响调节单胺代谢的关键基因的mRNA和蛋白表达,包括芳香族L-氨基酸脱羧酶(AADC)、多巴胺β-羟化酶(DβH)和单胺氧化酶A(MAO-A)。为支持我们临床前观察结果的转化价值,我们还发现SMN上调可增加接受Nusinersen治疗的SMA1患者脑脊液中去甲肾上腺素的浓度。
我们的发现凸显了低SMN水平对参与单胺代谢的关键酶表达的一种此前未被认识的有害影响,提示SMN诱导疗法可能调节儿茶酚胺神经传递。这些结果也可能与制定对抗SMA外周代谢缺陷的治疗策略相关。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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