PXD000933：HEK293细胞LC-MSMS——XBP1缓解氨基糖苷类诱导的内质网应激与神经元细胞死亡

资源简介

PXD000933：HEK293细胞LC-MSMS——XBP1缓解氨基糖苷类诱导的内质网应激与神经元细胞死亡

PXD000933 数据集来源于 ebi.ac.uk，归入神经系统疾病/其他分类，围绕 HEK293 细胞的 LC-MSMS 分析展开。该数据集采用 iTRAQ 4-plex 实验设计，包含 2 个未处理 HEK 细胞的生物学重复（分别以 114 和 116 标记）以及 2 个经遗传霉素（16 µM）处理 32 小时的 HEK 细胞生物学重复（分别以 115 和 117 标记）。数据集主题涉及人类、LC-MSMS、氨基糖苷类、HEK293 以及智人（Homo sapiens，NEWT:9606）等标签，英文名称中还提及 XBP1 缓解氨基糖苷诱导的内质网应激与神经元细胞死亡这一研究背景。整体而言，该数据集提供了在特定氨基糖苷类处理条件下对人类 HEK293 细胞进行定量蛋白质组学分析的相关信息。

【数据集背景】

该数据集与氨基糖苷类诱导的内质网应激及神经元细胞死亡的研究背景相关，英文名称中明确提及 XBP1 缓解氨基糖苷诱导的内质网应激和神经元细胞死亡。数据集被归入神经系统疾病/其他分类，主题标签涵盖人类、LC-MSMS、氨基糖苷类、HEK293 以及智人（Homo sapiens，NEWT:9606）。这些信息表明该数据集处于氨基糖苷类作用机制与细胞应激响应研究的语境之中，涉及 HEK293 细胞这一人类细胞模型。关于该研究更完整的立项背景、科学假设及实验目的，源站未提供。

【数据内容】

数据集的核心内容为 HEK293 细胞的 LC-MSMS 分析数据，实验采用 iTRAQ 4-plex 标记策略。根据源站描述，实验包含 2 个未处理 HEK 细胞的生物学重复，分别使用 114 和 116 标记；同时包含 2 个经遗传霉素（16 µM）处理 32 小时的 HEK 细胞生物学重复，分别使用 115 和 117 标记。主题标签中还包括 MS:1000932 等受控词汇条目。除上述标记与分组信息外，数据集所包含的具体蛋白鉴定数量、定量结果、差异表达蛋白列表等详细内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。实验对象为 HEK293 细胞，处理条件为遗传霉素 16 µM、处理时长 32 小时，并设置未处理对照。检测手段为 LC-MSMS，结合 iTRAQ 4-plex 进行生物学重复标记。样本的生物学来源为智人（Homo sapiens，NEWT:9606）。关于样本制备流程、质谱仪器型号、色谱条件、数据采集参数等更详细的采集信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于涉及氨基糖苷类处理下 HEK293 细胞蛋白质组变化的分析场景，可用于了解 iTRAQ 4-plex 定量蛋白质组学在细胞应激研究中的应用方式。结合其神经系统疾病/其他分类及氨基糖苷类、内质网应激、神经元细胞死亡等背景信息，该数据集可为相关机制研究提供数据参考。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

该数据集采用 iTRAQ 4-plex 标记设计，使用者可依据 114、116 标记对应未处理 HEK 细胞生物学重复，115、117 标记对应遗传霉素（16 µM，32 小时）处理 HEK 细胞生物学重复这一分组信息，对 LC-MSMS 数据进行比较分析。关于数据文件的具体格式、下载方式、分析流程及软件参数等使用层面的详细信息，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集设置了 2 个未处理组生物学重复和 2 个处理组生物学重复，采用 iTRAQ 4-plex 标记结合 LC-MSMS 进行分析。关于数据质量评估指标、重复间一致性、定量准确性、覆盖度以及实验设计方面的局限，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。关于数据集的引用方式、许可条款及使用限制，源站未提供。