神经元蜡样脂褐质沉积症外周可及生物标志物的蛋白质组学分析
该数据集来自 datashare.ed.ac.uk,聚焦神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)的外周可及生物标志物研究。数据为蛋白质组学数据,来源于 CLN3 和 PPT1 两种 Batten 病小鼠模型的骨骼肌,采用 iTRAQ 和非标记(Label free)蛋白质组学方法生成

基本信息
资源简介
神经元蜡样脂褐质沉积症外周可及生物标志物的蛋白质组学分析
该数据集聚焦神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)外周可及生物标志物的蛋白质组学研究,数据来源于 CLN3 与 PPT1 两种 Batten 病小鼠模型的骨骼肌组织,采用 iTRAQ 标记与非标记(Label free)两种蛋白质组学策略生成。Batten 病属于溶酶体贮积障碍,其神经系统病变的临床评估通常依赖侵入性较强的样本采集,因此在外周组织(如骨骼肌)中寻找可及的生物标志物具有潜在的应用价值。该数据集由 datashare.ed.ac.uk 发布,归类于神经系统疾病下的其他类别,主题标签涵盖肌肉、蛋白质组学、CLN3、PPT1、Batten 病及溶酶体贮积障碍,可为相关研究提供蛋白质表达层面的原始数据资源。
【数据集背景】
神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)是一组以溶酶体贮积为特征的神经系统疾病,Batten 病是其中具有代表性的类型。CLN3 与 PPT1 是与之相关的两种模型,分别对应不同的分子缺陷背景。该数据集所依托的研究关注的是外周可及生物标志物,即尝试从易于获取的外周组织中寻找能够反映疾病状态的蛋白质指标,而非仅依赖中枢神经系统相关的样本。骨骼肌作为外周组织的一种,被选作本数据集的蛋白质组学分析对象,用以探索在 CLN3 和 PPT1 小鼠模型中可能存在的蛋白质表达变化。
【数据内容】
该数据集的内容为蛋白质组学数据,具体由 iTRAQ 和非标记(Label free)两种方法生成。数据来源于 CLN3 和 PPT1 两种 Batten 病小鼠模型的骨骼肌。iTRAQ 是一种标记定量蛋白质组学策略,非标记方法则不依赖同位素标记进行定量。两种方法并行使用,可从不同技术路径获取骨骼肌样本中的蛋白质信息。数据所涉及的主题标签包括 Muscle、Proteomic、CLN3、PPT1、Batten Disease 和 Lysosomal Storage Disorder,反映了其在组织类型、技术手段和疾病模型方面的覆盖范围。
【采集与来源】
该数据集来源于 datashare.ed.ac.uk。源站描述指出,数据为 iTRAQ 和 Label free 蛋白质组学数据,生成自 CLN3 和 PPT1 两种 Batten 病小鼠模型的骨骼肌。除上述来源与样本信息外,关于具体采集时间、样本量、动物饲养条件、实验批次等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容,该数据集可适用于与 Batten 病及溶酶体贮积障碍相关的蛋白质组学研究,尤其是围绕外周组织(骨骼肌)中候选生物标志物的探索。由于同时包含 CLN3 和 PPT1 两种模型的数据,也可用于比较不同模型背景下骨骼肌蛋白质表达特征的异同。此外,采用 iTRAQ 与非标记两种方法生成的数据,可为方法学比较或数据整合分析提供素材。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否支持其他具体应用,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以蛋白质组学数据形式提供,使用者可根据自身研究目的对 iTRAQ 或非标记数据进行相应分析。关于数据的具体文件格式、下载方式、预处理步骤、分析流程或配套工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于小鼠模型的骨骼肌样本,并非来自人类受试者,因此其结论向临床外推时需谨慎。数据仅涵盖 CLN3 和 PPT1 两种模型,未涉及其他 NCL 亚型或对照组的详细信息。关于数据的完整性、重复性、定量准确性、缺失值情况以及是否存在批次效应等质量相关指标,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或授权要求,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/2945
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
从Batten病小鼠模型CLN3和PPT1的骨骼肌中生成的iTRAQ和无标记蛋白质组学数据。
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