PRJDB16703:深度烧伤与认知障碍

建立深度烧伤小鼠模型,对肠道微生物组、脑组织蛋白质组和代谢组进行高通量测序,并通过生物信息学分析探索与认知障碍相关的改变和生物标志物

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基因组分类深度烧伤认知障碍肠道微生物组脑组织蛋白质组代谢组高通量测序生物信息学分析
PRJDB16703: Deep burns and cognitive impairment

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

PRJDB16703:深度烧伤与认知障碍

PRJDB16703 是一个围绕深度烧伤与认知障碍关系构建的动物实验数据集,英文名称为 Deep burns and cognitive impairment。该数据集以小鼠为研究对象,通过建立深度烧伤模型,并对肠道微生物组、脑组织蛋白质组和代谢组开展高通量测序,结合生物信息学分析,探索深度烧伤后与认知障碍相关的改变及潜在生物标志物。数据集在站内归入神经系统疾病下的其他类别,来源站为 ebi.ac.uk。整体而言,该数据集面向烧伤后中枢神经系统功能改变的多组学研究,强调从肠道微生物、脑组织蛋白质与代谢物等多个层面获取高通量数据,为理解深度烧伤引发认知障碍的生物学基础提供数据支撑。

【数据集背景】

深度烧伤不仅造成局部组织损伤,还可能引起全身性病理生理改变,其中认知功能障碍是值得关注的并发症之一。源站描述指出,该数据集旨在建立深度烧伤小鼠模型,并以此为基础开展多组学高通量测序,探索与认知障碍相关的改变和生物标志物。数据集被归入神经系统疾病/其他类别,说明其研究关注点落在烧伤后继发的神经功能问题上。通过肠道微生物组、脑组织蛋白质组和代谢组的联合分析,该数据集试图从外周微生物与中枢分子层面建立联系,为深度烧伤相关认知障碍的机制研究和标志物发现提供实验数据基础。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集包含三类高通量测序或组学数据:肠道微生物组数据、脑组织蛋白质组数据和脑组织代谢组数据。研究对象为深度烧伤小鼠模型。数据内容围绕上述三个组学层面展开,用于通过生物信息学分析识别与认知障碍相关的改变和生物标志物。源站未提供样本量、测序平台、具体检测指标、数据文件格式及数据规模等细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述表明,数据采集基于深度烧伤小鼠模型,采集对象包括肠道微生物组、脑组织蛋白质组和代谢组,并采用高通量测序技术获取数据。源站未提供动物品系、烧伤模型的具体制备方法、样本采集时间点、测序平台型号及数据处理流程等信息。

【适用场景】

该数据集适用于深度烧伤后认知障碍相关的多组学研究场景,包括肠道微生物组与脑组织蛋白质组、代谢组的联合分析,认知障碍相关改变的模式探索,以及潜在生物标志物的筛选与验证研究。也可用于生物信息学分析方法在烧伤继发神经功能改变研究中的应用参考。源站未提供具体适用疾病亚型、人群外推或临床转化方面的说明。

【使用方法】

源站描述提到通过生物信息学分析探索与认知障碍相关的改变和生物标志物,但未提供数据下载方式、文件组织方式、分析流程、软件工具及参数设置等具体使用说明。源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供数据质量评估、质控指标、缺失值情况、批次效应处理及数据完整性说明。该数据集基于小鼠模型,源站未提供其结果向其他物种或临床场景外推的限制说明。源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式、许可协议及数据使用条款等信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB16703

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

建立深部烧伤小鼠模型,对肠道微生物组、脑组织蛋白质组和代谢组进行高通量测序,并通过生物信息学分析探讨与认知功能障碍相关的改变及生物标志物。

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