用于青光眼分析的SHIP肠道微生物组数据集

该数据集是一个基于人群的肠道微生物组数据集,通过16S rRNA基因测序技术对2,546名波美拉尼亚健康研究参与者的粪便样本进行分析,数据模态包括基因序列和微生物组组成信息,主要用于探究青光眼患病率与肠道微生物组之间的关联,支持微生物组学、眼科疾病及流行病学等领域的研究。

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Mendeley Data
2024-05-10 更新
浏览 25
肠道微生物组青光眼
SHIP Gut Microbiome Dataset for Glaucoma Analysis

基本信息

大小
0.000748991 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2024-05-10
版本
v1

资源简介

用于青光眼分析的SHIP肠道微生物组数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《SHIP gut microbiome dataset for glaucoma analysis》。源站首次发布:2023-09-05。

【数据内容】

源站原始描述:The Study of Health in Pomerania (SHIP) is a population-based study. SHIP consists of the two independent cohorts: SHIP-START and SHIP-TREND. The aim of the study is the investigation of common risk factors, subclinical disorders and manifest diseases in the population of Northeast Germany. 16S rRNA gene sequencing was performed as described elsewhere (1,2). In brief, fecal samples were collected at home, and then transported to the laboratory by the participants or courier. The DNA was isolated…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 748.99 KB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.8318223。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/8318223

使用许可:cc-by-4.0。

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使用方式

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源站:https://zenodo.org/records/8318223

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数据说明

该数据集来源于波美拉尼亚健康研究(SHIP),这是一项基于人群的研究,包含SHIP-START和SHIP-TREND两个独立队列,旨在调查德国东北部人群的常见风险因素、亚临床疾病和显性疾病。数据集通过16S rRNA基因测序(V1-V2区域)构建,使用Illumina MiSeq平台对参与者提供的粪便样本进行测序,并通过DADA2软件处理扩增子数据,样本标准化至10,000个16S rRNA基因读数。该数据集主要用于复制分析,以探究青光眼患病率与肠道微生物组之间的关联,共包含2,546名SHIP参与者的数据,适用于微生物组学、眼科疾病及人群健康研究。

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