用于青光眼分析的SHIP肠道微生物组数据集
该数据集是一个基于人群的肠道微生物组数据集,通过16S rRNA基因测序技术对2,546名波美拉尼亚健康研究参与者的粪便样本进行分析,数据模态包括基因序列和微生物组组成信息,主要用于探究青光眼患病率与肠道微生物组之间的关联,支持微生物组学、眼科疾病及流行病学等领域的研究。
创建时间2023-09-12
更新时间2024-05-10
资源简介
该数据集来源于波美拉尼亚健康研究(SHIP),这是一项基于人群的研究,包含SHIP-START和SHIP-TREND两个独立队列,旨在调查德国东北部人群的常见风险因素、亚临床疾病和显性疾病。数据集通过16S rRNA基因测序(V1-V2区域)构建,使用Illumina MiSeq平台对参与者提供的粪便样本进行测序,并通过DADA2软件处理扩增子数据,样本标准化至10,000个16S rRNA基因读数。该数据集主要用于复制分析,以探究青光眼患病率与肠道微生物组之间的关联,共包含2,546名SHIP参与者的数据,适用于微生物组学、眼科疾病及人群健康研究。
提供机构:Zenodo
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