λ干扰素重塑鼻腔微生物组并增加金黄色葡萄球菌重叠感染易感性

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.v1ff0

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 557.5 MB。

数据说明

与流感病毒呼吸道感染相关的许多发病率和死亡率，是由定植于上呼吸道的病原体引起的细菌共感染所致，例如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）和肺炎链球菌。针对流感病毒免疫反应的一个主要组成部分是I型和III型干扰素的产生。在此，我们表明，感染流感病毒后的免疫反应会导致野生型（WT）小鼠上呼吸道微生物群增加并发生重构，但在缺乏III型干扰素受体的Il28r−/−突变小鼠中则不会。缺乏IL-28受体的小鼠无法诱导STAT1磷酸化及其调节因子SOCS1的表达。Il28r−/−突变小鼠鼻腔中白介素-22（IL-22）以及Ngal和RegIIIγ的表达增加，而鼻腔是被吸入后可引起肺炎的微生物的来源。蛋白质组学分析揭示，鼻上皮中几种有助于屏障功能的细胞骨架蛋白发生变化，这可能促成IL-28信号对微生物群的影响。IL-28信号效应在流感病毒感染后MRSA肺炎发病机制中的重要性得到证实：与Il28r−/−突变小鼠相比，在流感病毒感染前或后经鼻定植的WT小鼠上呼吸道感染水平显著更高，并且对MRSA肺炎的易感性显著更高。我们的结果提示，针对流感病毒感染的III型干扰素激活在扩大上呼吸道微生物组并增加下呼吸道感染易感性方面具有重要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。