多发性硬化患者B细胞清除治疗中粪便与口腔微生物组纵向变化
目的：阐明多发性硬化（MS）患者口腔和粪便微生物组的横断面模式与纵向变化，以及B细胞清除的影响。方法：我们开展了一项观察性、纵向临床队列研究，在12个月内分析四个时间点（第0天和第14天、第24周和第52周），纳入37例MS患者，其中22例开始接受ocrelizumab的B细胞清除治疗，15例为年龄
基本信息
资源简介
多发性硬化患者B细胞清除治疗中粪便与口腔微生物组纵向变化
MGYS00006794 是一项聚焦多发性硬化（MS）患者口腔与粪便微生物组的研究数据集，其英文全称为 Longitudinal changes of stool and oral microbiota composition in patients with multiple sclerosis undergoing B-cell depletion。该数据集来源于 ebi.ac.uk，在本站归类于神经系统疾病 / 其他。研究围绕 MS 患者口腔和肠道微生物组的横断面模式与纵向变化展开，并进一步考察 B 细胞清除治疗对微生物组的影响。研究采用观察性、纵向临床队列设计，在 12 个月内设置四个时间点（第 0 天和第 14 天、第 24 周和第 52 周），共纳入 37 例 MS 患者，其中 22 例开始接受 ocrelizumab 的 B 细胞清除治疗，15 例为年龄和性别匹配的未治疗 MS 患者。口腔与肠道微生物组分析基于所有受试者提供的粪便和口腔拭子样本，采用 16S rDNA 测序及后续生物信息学分析，同时登记临床结局与 MRI 结果。
【数据集背景】
多发性硬化是一种神经系统疾病，其发生发展可能与微生物组的变化相关。该研究旨在阐明 MS 患者口腔和粪便微生物组的横断面模式与纵向变化，并评估 B 细胞清除治疗对口腔和肠道微生物组的影响。研究对象为 MS 患者，其中部分患者接受以 ocrelizumab 进行的 B 细胞清除治疗，另一部分为年龄和性别匹配的未治疗 MS 患者。研究同时关注临床结局与 MRI 结果，以期为理解 MS 与微生物组之间的关系以及 B 细胞清除治疗的作用提供数据基础。
【数据内容】
该数据集涉及口腔和粪便微生物组的分析数据。所有受试者提供的粪便和口腔拭子样本均接受了 16S rDNA 测序，并进行了后续生物信息学分析。研究在 12 个月内设置了四个时间点，分别为第 0 天和第 14 天、第 24 周和第 52 周，以捕捉口腔和粪便微生物组的纵向变化。研究还登记了临床结局和 MRI 结果。与健康对照相比，MS 患者在粪便中表现出 alpha 多样性降低、拟杆菌门（Bacteroidetes）检出显著增加，以及产丁酸的厚壁菌门（Firmicutes）成员丰度较低。关于数据集的具体样本量、序列数据规模、文件类型与数据结构等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk。研究为观察性、纵向临床队列研究，共纳入 37 例 MS 患者，其中 22 例开始接受 ocrelizumab 的 B 细胞清除治疗，15 例为年龄和性别匹配的未治疗 MS 患者。样本类型包括粪便和口腔拭子，采集时间点覆盖第 0 天和第 14 天、第 24 周和第 52 周，总跨度为 12 个月。所有样本均经过 16S rDNA 测序和后续生物信息学分析。临床结局与 MRI 结果也被登记。关于样本采集的具体地点、伦理审批信息、测序平台与试剂等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究多发性硬化患者口腔和粪便微生物组的横断面模式与纵向变化，以及 B 细胞清除治疗对微生物组组成的影响。具体而言，可用于分析 MS 患者与健康对照之间在 alpha 多样性、拟杆菌门检出以及产丁酸厚壁菌门成员丰度方面的差异；也可用于考察在 12 个月内四个时间点上口腔与粪便微生物组的动态变化，并结合临床结局与 MRI 结果进行关联分析。此外，该数据集可用于探索 B 细胞清除治疗背景下微生物组的变化特征。关于其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，可基于 16S rDNA 测序及生物信息学分析结果，对口腔和粪便微生物组进行比较与纵向分析。研究设计包含四个时间点（第 0 天和第 14 天、第 24 周和第 52 周），可支持时间序列层面的微生物组变化分析。分析时可区分接受 ocrelizumab B 细胞清除治疗的 22 例患者与 15 例年龄和性别匹配的未治疗 MS 患者，并参考临床结局与 MRI 结果。关于数据下载方式、预处理流程、分析工具与参数设置等，源站未提供。
【质量与限制】
该研究为观察性、纵向临床队列研究，样本来自 37 例 MS 患者，其中 22 例接受 B 细胞清除治疗，15 例为年龄和性别匹配的未治疗患者。研究设置了四个时间点，跨度为 12 个月，并采用 16S rDNA 测序和后续生物信息学分析。研究结果报告了与健康对照相比，MS 患者粪便中 alpha 多样性降低、拟杆菌门检出显著增加以及产丁酸厚壁菌门成员丰度较低。关于该数据集的局限性、偏倚控制、样本量论证、数据完整性及质控细节等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的引用方式、许可条款、使用限制与授权信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/metagenomics/studies/MGYS00006794
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目的：阐明多发性硬化（MS）患者口腔和粪便微生物群的横断面模式及纵向变化，以及B细胞清除治疗的影响。方法：我们开展了一项观察性、纵向临床队列研究，在12个月内对37例MS患者的四个时间点（第0天和第14天、第24周和第52周）进行分析，其中22例开始接受ocrelizumab的B细胞清除治疗，15例为年龄和性别匹配的未治疗MS患者。为分析口腔和肠道微生物群，所有提供的粪便和口腔拭子样本均进行了16S rDNA测序及后续生物信息学分析。记录临床结局和MRI结果。结果：与健康对照相比，MS患者粪便中α多样性降低，拟杆菌门检出率显著增加，而厚壁菌门中产丁酸菌的丰度较低。口腔微生物群模式也表现出α多样性降低，但与粪便相比显示出独特且不同的微生物群变化，如变形菌门水平升高和放线菌门丰度降低。
值得注意的是，在启动B细胞清除治疗后，我们观察到肠道和口腔中的α多样性增加，以及促炎性革兰阴性菌（如埃希菌/志贺菌）长期持续减少。结论：与健康对照相比，多发性硬化症患者的粪便和口腔微生物群多样性模式发生了改变，这些改变在疾病活动度和残疾程度较高的患者中最为明显。治疗性B细胞清除与这些变化的持续消退相关。这些微生物变化究竟是B细胞清除的非特异性副作用，还是间接调节多发性硬化症的疾病活动度和进展，目前尚不清楚，需要进一步研究。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
