遗传性感觉和自主神经病1C型—基因-疾病关联数据

源站描述介绍了CMT4C由SH3TC2双等位基因致病变异引起,研究在700例无亲缘关系的俄罗斯CMT患者中开展21个遗传性神经病相关基因的panel分析,其中394例为脱髓鞘型,鉴定出10例CMT4C及4个新变异和9个已报道变异

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2024-06-06 更新
浏览 11
基因组分类SH3TC2CMT4CmutationneuropathyCharcot-Marie-Tooth disease type 4Chereditary motor and sensory neuropathyHMSN
neuropathy, hereditary sensory and autonomic, type 1C — Gene-Disease Associations

基本信息

模态
基因组
大小
0.000011123 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-06-06
版本
v1

资源简介

遗传性感觉和自主神经病1C型—基因-疾病关联数据

Table1_Genetic Landscape of SH3TC2 variants in Russian patients with Charcot–Marie–Tooth disease.XLSX

该数据集来自frontiersin.figshare.com,为XLSX表格文件,标题涉及俄罗斯Charcot–Marie–Tooth病患者中SH3TC2变异的遗传景观。源站描述介绍了CMT4C由SH3TC2双等位基因致病变异引起,研究在700例无亲缘关系的俄罗斯CMT患者中开展21个遗传性神经病相关基因的panel分析,其中394例为脱髓鞘型,鉴定出10例CMT4C及4个新变异和9个已报道变异。数据可用于SH3TC2变异谱与CMT4C基因-疾病关联的参考(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Mutational screening of the SH3TC2 gene in Greek patients with suspected demyelinating recessive Charcot‐Marie‐Tooth disease reveals a varied and unusual phenotypic spectrum》发表于 Journal of the Peripheral Nervous System(2019),DOI:10.1111/jns.12305。源站首次发布:2024-06-06。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):引言:Charcot–Marie–Tooth病4C型(CMT4C)OMIM#601596是全球最常见的隐性运动感觉神经病之一。该病由SH3TC2基因的双等位基因致病变异引起。方法:在一个由700名无亲缘关系的俄罗斯Charcot–Marie–Tooth病患者组成的队列中,我们进行了涵盖21个遗传性神经病相关基因的基因panel分析。队列中有394人表现为脱髓鞘型运动感觉神经病。结果与讨论:值得注意的是,该队列中鉴定出10例CMT4C。在缺乏PMP22重复的俄罗斯脱髓鞘型CMT患者中,CMT4C的患病率估计为2.5%,与欧洲人群中的观察结果显著不同。共鉴定出SH3TC2基因的4个新变异和9个已报道变异。No a

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 11.12 KB。数据集 DOI:10.3389/fgene.2024.1381915.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。主题标签:SH3TC2、CMT4C、mutation、neuropathy、Charcot-Marie-Tooth disease type 4C、hereditary motor and sensory neuropathy、HMSN。本站分类:神经系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table1_Genetic_Landscape_of_SH3TC2_variants_in_Russian_patients_with_Charcot_Marie_Tooth_disease_XLSX/25981018

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Shchagina, Olga; Murtazina, Aysylu; Chausova, Polina; Orlova, Mariya; Dadali, Elena; Kurbatov, Sergei; et al. (2024). Table1_Genetic Landscape of SH3TC2 variants in Russian patients with Charcot–Marie–Tooth disease.XLSX. Frontiers. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table1_Genetic Landscape of SH3TC2 variants in Russian patients with Charcot–Marie–Tooth disease.XLSX" "https://ndownloader.figshare.com/files/46854955"

文件清单

  • Table1_Genetic Landscape of SH3TC2 variants in Russian patients with Charcot–Marie–Tooth disease.XLSX(11.12 KB)

文件总体积 11.12 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

引言:腓骨肌萎缩症4C型(CMT4C,OMIM#601596)是全球最常见的隐性遗传运动感觉神经病之一。该疾病由SH3TC2基因的双等位基因致病性变异所致。

方法:在一个由700名确诊为腓骨肌萎缩症的无亲缘关系俄罗斯患者组成的队列中,我们进行了涵盖21个与遗传性神经病相关基因的基因面板分析。该队列中有394名个体表现为脱髓鞘性运动感觉神经病。

结果与讨论:值得注意的是,在该队列中鉴定出10例CMT4C病例。在缺乏PMP22重复的俄罗斯脱髓鞘型CMT患者中,CMT4C的患病率估计为2.5%,与欧洲人群中的观察结果存在显著差异。共鉴定出SH3TC2基因的4个新变异和9个既往报道的变异。未检测到主要变异的聚集现象。三个既往报道的变异——c.2860C>T p.(Arg954*)、p.(Arg658Cys)和c.279G>A p.(Lys93Lys)——在无亲缘关系的家族中反复检出。核苷酸改变p.(Arg954*)存在于我们大多数患者中(30%)。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fgene.2024.1381915.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table1_Genetic_Landscape_of_SH3TC2_variants_in_Russian_patients_with_Charcot_Marie_Tooth_disease_XLSX/25981018)。

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