子宫平滑肌肉瘤外显子测序揭示TP53、ATRX和MED12频繁突变
该数据集包含19例子宫平滑肌肉瘤的外显子测序数据,涉及基因突变、蛋白表达及端粒长度等多模态分子信息,主要用于分析TP53、ATRX和MED12等关键基因的突变频率及其与端粒替代延长表型的关联,为探索子宫平滑肌肉瘤的分子机制和潜在治疗策略提供数据支持。

基本信息
资源简介
子宫平滑肌肉瘤外显子测序揭示TP53、ATRX和MED12频繁突变
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Exome Sequencing of Uterine Leiomyosarcomas Identifies Frequent Mutations in TP53, ATRX, and MED12》。配套论文《Exome Sequencing of Uterine Leiomyosarcomas Identifies Frequent Mutations in TP53, ATRX, and MED12》发表于 PLOS Genetics(2016),DOI:10.1371/journal.pgen.1005850。源站首次发布:2016-02-18。
【数据内容】
源站原始描述:Uterine leiomyosarcomas (ULMSs) are aggressive smooth muscle tumors associated with poor clinical outcome. Despite previous cytogenetic and molecular studies, their molecular background has remained elusive. To examine somatic variation in ULMS, we performed exome sequencing on 19 tumors. Altogether, 43 genes were mutated in at least two ULMSs. Most frequently mutated genes included tumor protein P53 (TP53; 6/19; 33%), alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked (ATRX; 5/19; 26%), and…
【数据结构与技术规格】
文件数 6 个,合计 728.85 KB。S1 Fig.pdf:application/pdf,49.15 KB。S2 Fig.pdf:application/pdf,321.90 KB。S1 Table.pdf:application/pdf,298.81 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pgen.1005850。
【主题与分类】
源站学科分类:Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:exome sequencing、ULMS、MED 12 alterations、tumor protein P 53、DAXX、mutation、gene、ATRX expression、ALT phenotype、MED 12 Uterine leiomyosarcomas。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Exome_Sequencing_of_Uterine_Leiomyosarcomas_Identifies_Frequent_Mutations_in_i_TP53_i_i_ATRX_i_and_i_MED12_i_/2584510
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Mäkinen, Netta; Aavikko, Mervi; Heikkinen, Tuomas; Taipale, Minna; Taipale, Jussi; Koivisto-Korander, Riitta; et al. (2016). Exome Sequencing of Uterine Leiomyosarcomas Identifies Frequent Mutations in TP53, ATRX, and MED12. PLOS Genetics. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集基于19例子宫平滑肌肉瘤(ULMS)的外显子测序数据构建,旨在探究这种侵袭性平滑肌肿瘤的分子背景。数据包含体细胞变异信息,识别出在至少两个肿瘤中发生突变的43个基因,其中TP53、ATRX和MED12为最频繁突变基因。研究进一步通过免疫组化验证了ATRX蛋白表达缺失与端粒替代延长(ALT)表型的关联。该数据集为理解子宫平滑肌肉瘤的发病机制、发现潜在治疗靶点(如ATR抑制剂)提供了重要分子依据,适用于癌症基因组学、肿瘤分子病理及精准医疗研究方向。
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