动态成像相干源揭示癫痫发作产生与持续的不同网络连接

数据围绕局灶性癫痫发作的产生与持续机制,涉及对发作期头皮 EEG 数据使用动态成像相干源(DICS)分析相干源,并用重归一化偏定向相干(RPDC)方法研究有效连接

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2023-06-02 更新
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时间序列imagingcoherentsourcesrevealsconnectivityperpetuationepileptic
Dynamic Imaging of Coherent Sources Reveals Different Network Connectivity Underlying the Generation and Perpetuation of Epileptic Seizures

基本信息

模态
时间序列
大小
0.003939632 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-02
版本
v1

资源简介

动态成像相干源揭示癫痫发作产生与持续的不同网络连接

Dynamic Imaging of Coherent Sources Reveals Different Network Connectivity Underlying the Generation and Perpetuation of Epileptic Seizures

该数据集来自 plos.figshare.com,包含 11 个文件(如 Figure_S1.tif 至 Figure_S8.tif 等),配套论文发表于 PLoS ONE(2013 年)。数据围绕局灶性癫痫发作的产生与持续机制,涉及对发作期头皮 EEG 数据使用动态成像相干源(DICS)分析相干源,并用重归一化偏定向相干(RPDC)方法研究有效连接。数据集可用于探索癫痫网络的功能与有效连接研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Dynamic Imaging of Coherent Sources Reveals Different Network Connectivity Underlying the Generation and Perpetuation of Epileptic Seizures》发表于 PLoS ONE(2013),DOI:10.1371/journal.pone.0078422。源站首次发布:2013-10-23。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):局灶性癫痫的概念包括癫痫发作起源于具有超同步活动的脑区(致痫区和发作起始区),以及涉及不同脑区的复杂癫痫网络参与发作的产生、传播和调制。本工作旨在研究参与癫痫发作网络的脑区之间的功能连接和有效连接。使用动态成像相干源(DICS)分析局灶性发作的起始和中间部分的发作期头皮 EEG 数据,DICS 是一种频域逆解方法,描述神经元网络和振荡性脑活动的相干性。使用重归一化偏定向相干(RPDC)方法研究相干源之间的信息流(有效连接)。在 8/11 名患者中,癫痫活动的第一和第二源

【数据结构与技术规格】

文件数 11 个,合计 3.94 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0078422。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences、Information and Computing Sciences。主题标签:imaging、coherent、sources、reveals、connectivity、perpetuation、epileptic。本站分类:神经系统疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences、Information and Computing Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Dynamic_Imaging_of_Coherent_Sources_Reveals_Different_Network_Connectivity_Underlying_the_Generation_and_Perpetuation_of_Epileptic_Seizures_/830531

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Elshoff, Lydia; Muthuraman, Muthuraman; Rauf Anwar, Abdul; Deuschl, Günther; Stephani, Ulrich; Raethjen, Jan; et al. (2016). Dynamic Imaging of Coherent Sources Reveals Different Network Connectivity Underlying the Generation and Perpetuation of Epileptic Seizures. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Figure_S4.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1255475"
curl -L -o "Figure_S5.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1255476"
curl -L -o "Figure_S6.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1255477"
curl -L -o "Figure_S7.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1255478"
curl -L -o "Figure_S8.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1255479"

文件清单

  • Figure_S1.tif(304.93 KB)
  • Figure_S2.tif(495.38 KB)
  • Figure_S3.tif(364.97 KB)
  • Figure_S4.tif(316.23 KB)
  • Figure_S5.tif(410.84 KB)
  • Figure_S6.tif(381.94 KB)
  • Figure_S7.tif(356.25 KB)
  • Figure_S8.tif(133.57 KB)
  • Figure_S9.tif(410.60 KB)
  • Figure_S10.tif(410.76 KB)
  • Figure_S11.tif(354.17 KB)

文件总体积 3.94 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

局灶性癫痫的概念包括癫痫发作起源于具有超同步活动的脑区(致痫区和发作起始区),以及一个由不同脑区参与的复杂癫痫网络,该网络涉及癫痫发作的产生、传播和调制。本研究旨在探讨参与癫痫发作网络的各脑区之间的功能连接和有效连接。采用相干源动态成像(DICS)——一种在频域中描述神经网络和振荡性脑活动相干性的逆解方法——对发作期头皮脑电图数据中局灶性癫痫发作的起始部分和中段进行分析。采用重归一化偏定向相干(RPDC)方法研究相干源之间的信息流(有效连接)。在11例患者中的8例,DICS所发现的癫痫活动第一和第二源与手术切除部位一致;这些患者在癫痫手术后达到无发作。在其余3例患者中,DICS/RPDC计算结果与切除部位不一致;这些患者的术后结局较差。

DICS所发现的第一个源主要位于皮层结构;随后的源包括一些皮层下结构:丘脑、丘脑底核和小脑。DICS似乎是界定癫痫发作起始区和所涉及癫痫网络的有力工具。癫痫发作的产生似乎与癫痫活动从发作起始区的主要源扩散有关,而发作的维持则归因于癫痫网络中各节点之间癫痫活动的持续。尽管这些结果令人鼓舞,但这项原理验证研究在将所述方法用于临床实践之前仍需进一步确认。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0078422(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Dynamic_Imaging_of_Coherent_Sources_Reveals_Different_Network_Connectivity_Underlying_the_Generation_and_Perpetuation_of_Epileptic_Seizures_/830531)。

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