氨基酸与酰基肉碱血浆谱变化用于区分多发性硬化患者与健康对照

该数据集来自 omicsdi.org,聚焦多发性硬化与健康对照的代谢组学差异。研究采用基于串联质谱的靶向代谢组学方法,检测干血浆斑中的氨基酸与酰基肉碱,并结合多变量统计分析比较多发性硬化组(n=16)与对照组(n=12)

omicsdi
浏览 3
医学影像分类Metabolomics
Changes in Amino Acid and Acylcarnitine Plasma Profiles for Distinguishing Patients with Multiple Sclerosis from Healthy Controls

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

氨基酸与酰基肉碱血浆谱变化用于区分多发性硬化患者与健康对照

该数据集聚焦于多发性硬化与健康对照之间在血浆代谢谱上的差异,采用基于串联质谱的靶向代谢组学方法,对干血浆斑中的氨基酸与酰基肉碱进行检测,并借助多变量统计分析比较两组人群的代谢特征。研究纳入多发性硬化患者16例与对照组12例,旨在探索氨基酸与酰基肉碱血浆谱变化是否有助于区分多发性硬化患者与健康对照。数据集来源于omicsdi.org,归类于神经系统疾病下的其他类别,主题标签为代谢组学。整体而言,该数据集为理解多发性硬化相关的代谢通路扰动及潜在诊断标志物研究提供了针对性的代谢组学资料。

【数据集背景】

多发性硬化的诊断目前主要依赖McDonald标准与磁共振成像,但临床决策的制定需要耗费相当长的时间。已有研究表明,多发性硬化患者体内氨基酸与脂肪酸代谢通路存在扰动,这类代谢信息可能对诊断具有参考价值。基于这一背景,相关研究致力于寻找氨基酸与酰基肉碱血浆谱的变化,以区分多发性硬化患者与健康对照,从而为诊断环节提供代谢层面的补充线索。

【数据内容】

该数据集的核心内容是干血浆斑中氨基酸与酰基肉碱的靶向代谢组学检测结果,以及在此基础上开展的多变量统计分析结果。研究比较了多发性硬化组(n=16)与对照组(n=12)之间的代谢谱差异。分析过程中发现,偏最小二乘判别分析在组间分类上的表现优于主成分线性判别分析。数据集的主题标签为代谢组学,所属分类为神经系统疾病下的其他类别。

【采集与来源】

数据集来源于omicsdi.org。研究采用基于串联质谱分析的靶向代谢组学方法,检测对象为干血浆斑中的氨基酸与酰基肉碱,随后结合多变量统计分析以发现多发性硬化组与对照组之间的差异。样本层面涉及多发性硬化患者16例与健康对照12例。其余关于采样时间、地点、仪器型号等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与多发性硬化相关的代谢组学研究,尤其是围绕氨基酸与酰基肉碱血浆谱差异的探索性分析。其潜在用途包括:支持代谢通路扰动与疾病状态之间关系的比较研究;为区分多发性硬化患者与健康对照的分类方法研究提供数据基础;以及作为靶向代谢组学方法在神经系统疾病中应用的参考案例。需要说明的是,这些用途属于领域内的通用方向,数据集本身的具体应用范围源站未提供。

【使用方法】

依据源站描述,该数据集对应的分析流程为:先对干血浆斑中的氨基酸与酰基肉碱进行串联质谱检测,获得靶向代谢组学数据;再采用多变量统计分析方法比较多发性硬化组与对照组。研究结果显示,偏最小二乘判别分析相较主成分线性判别分析取得了更好的组间分类效果。关于数据文件格式、预处理步骤、软件参数及具体操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该研究的样本量较小,多发性硬化组为16例,对照组为12例,这一规模可能影响统计结果的稳健性与外推能力。研究采用的是靶向代谢组学方法,检测范围限定于氨基酸与酰基肉碱,未涵盖更广泛的代谢物。此外,源站描述中未提供关于样本采集规范、批次效应控制、缺失值处理及验证集设置等信息,相关质量控制细节源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS704

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

McDonald标准与磁共振成像(MRI)被用于多发性硬化症(MS)的诊断;然而,做出临床决策需要相当长的时间。多发性硬化症中氨基酸和脂肪酸代谢途径受到干扰,这一信息可能有助于诊断。我们研究的目的是发现氨基酸和酰基肉碱血浆谱的变化,以区分多发性硬化症患者与健康对照者。我们采用了一种靶向代谢组学方法,基于干血浆斑中氨基酸和酰基肉碱的串联质谱分析,随后进行多变量统计分析,以发现多发性硬化症组(n = 16)与对照组(n = 12)之间的差异。研究发现,与主成分线性判别分析和随机森林算法相比,偏最小二乘判别分析获得了更好的组分类效果。所有三种模型均检测到多发性硬化症组相对于对照组的氨基酸和酰基肉碱谱的显著变化。我们的结果为临床决策支持系统的进一步开发带来了希望。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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