清醒小鼠听觉、触须、嗅觉与Go/No-Go范式功能磁共振数据集

该数据集为清醒小鼠功能磁共振成像(fMRI)的整理衍生数据,整合听觉、触须、嗅觉及基于气味的Go/No-Go范式。主要发布包含51条任务特异性小鼠记录和497个独特成像运行,涵盖重复时间(TR)为0.35秒和1.5秒的配对感觉采集,以及TR=1.5秒的Go/No-Go采集

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医学影像NeurobiologyBiomedical engineeringBiologyawake mouse fMRIsensory stimulationmousefMRI
An Awake Mouse Functional MRI Dataset of Auditory, Whisker, Olfactory, and Go/No-Go Paradigms

基本信息

模态
医学影像
许可
Creative Commons Attribution Non Commercial 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

清醒小鼠听觉、触须、嗅觉与Go/No-Go范式功能磁共振数据集

An Awake Mouse Functional MRI Dataset of Auditory, Whisker, Olfactory, and Go/No-Go Paradigms

该数据集为清醒小鼠功能磁共振成像(fMRI)的整理衍生数据,整合听觉、触须、嗅觉及基于气味的Go/No-Go范式。主要发布包含51条任务特异性小鼠记录和497个独特成像运行,涵盖重复时间(TR)为0.35秒和1.5秒的配对感觉采集,以及TR=1.5秒的Go/No-Go采集。数据提供组织化的预处理NIfTI图像、采集与运动侧车文件及一阶统计结果,可用于研究局部神经活动与系统级脑功能的关系(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution Non Commercial 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):清醒小鼠功能磁共振成像(fMRI)能够在生理相关条件下实现全脑活动映射,为研究局部神经活动与系统级脑功能之间的关系提供了强大方法。然而,清醒小鼠fMRI数据的重复使用常受限于采集协议异质、对运动敏感以及衍生数据报告不完整。在此,我们展示一个整理衍生数据集,整合了在清醒小鼠中采集的听觉、触须、嗅觉及基于气味的Go/No-Go范式。主要发布包含51条任务特异性小鼠记录和497个独特成像运行,包括重复时间(TR)为0.35秒和1.5秒的配对感觉采集,以及TR=1.5秒的Go/No-Go采集。该数据集包括组织化的预处理NIfTI图像、采集与运动侧车文件、一阶sta

【主题与分类】

主题标签:Neurobiology、Biomedical engineering、Biology、awake mouse fMRI、sensory stimulation、mouse、fMRI。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=d340727ea0af4394a8298d3b05289de0

使用许可:Creative Commons Attribution Non Commercial 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.57760/sciencedb.nb.0002t

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

清醒小鼠功能磁共振成像(fMRI)能够在生理相关条件下实现全脑活动映射,并为研究局部神经活动与系统级脑功能之间的关系提供了强有力的方法。然而,清醒小鼠fMRI数据的再利用往往受限于采集方案异质性、对运动的敏感性以及衍生数据报告不完整等问题。在此,我们呈现一个经过整理的精编衍生数据集,整合了在清醒小鼠中采集的听觉、触须、嗅觉以及基于气味的Go/No-Go范式数据。主要发布内容包括51条任务特异性小鼠记录和497次独特成像扫描,涵盖重复时间(TR)为0.35 s和1.5 s的配对感觉采集,以及TR = 1.5 s的Go/No-Go采集。该数据集包含整理好的预处理NIfTI图像、采集与运动侧文件、一阶统计输出、二阶汇总、图谱资源以及扫描级和受试者级质量控制表。

衍生数据通过标准化处理流程生成,该流程包括切片时间校正、重新对齐与重采样、空间平滑、运动回归、血流动力学响应的TR特异性汇总、针对TR=1.5秒采集的感觉数据的AR(0.2)一级建模,以及逐帧位移(FD)、DVARS、信噪比(SNR)和时间信噪比(tSNR)的定量评估。该数据集为跨模态感觉映射、时间分辨率比较、小鼠血流动力学响应特征描述、清醒fMRI的质量基准测试以及方法学发展提供了资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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